从细菌中稳定并纯化至多100 μg的总RNA
- 立即稳定和保护体内的RNA
- 基因表达和基因谱数据可靠
- 无需使用液氮、干冰或苯酚
- 快速获得即用型高品质总RNA
- 无需氯化铯梯度离心,无需氯化锂或乙醇沉淀
RNeasy Protect Bacteria Mini Kit包含RNAprotect Bacteria Reagent和RNeasy离心柱,前者用于稳定细菌样本中的RNA,后者使用硅胶膜技术纯化得到至多100 µg高品质RNA。可通过使用TissueLyser II实现GX破碎细菌样品。纯化过程可在QIAcube全自动核酸纯化仪上自动运行。
RNeasy Protect Bacteria Mini Kit适用于分子生物学应用。该产品不适用于疾病的诊断、预防或ZL。
Performance
使用传统方法进行细胞收集和RNA分离时,RNA酶解会导致很多转录体的减少或丢失。这种减少在细菌mRNA分子中尤其明显,因为它们通常只有几分钟的半衰期。此外,在操作处理细菌样本过程中,一些基因会被诱导,导致部分基因的高表达。使用RNAprotect Bacteria Reagent可以在分离RNA之前迅速稳定RNA(参见"RNAprotect Bacteria Reagent prevents mRNA degradation"和"Accurate gene expression profiles")。E. coli(6 x 108个细胞)的RNA产量是100 µg,Bacillus subtilis(1 x 108个细胞) 的RNA产量是15 µg。用此试剂盒纯化得到的RNA品质高,其A260/A280比值为1.9–2.1(测于10 mM Tris·Cl、pH 7.5)。
Principle
RNeasy Protect Bacteria Mini Kit提供RNA保护和分离的完整解决方案,在一个试剂盒中完成从样品收集到RNA纯化的整个过程。经验证的RNeasy硅胶膜技术与用于稳定RNA的RNAprotect Bacteria Reagent相结合,可纯化得到高品质、完整的RNA。这个过程有效地保护了样品收集过程中的细菌表达谱,确保可靠的基因表达分析结果。样本稳定后,RNeasy技术整合了异硫氰酸胍裂解的严谨性和硅胶膜纯化的纯度及速度,过程更加简洁(参见"RNeasy Mini spin column")。
Procedure
在RNA分离前,直接向1体积的细菌培养基(≤7.5 x 108个细菌)中加入2体积的RNAprotect Bacteria Reagent,可立即稳定RNA(参见"RNAprotect Bacteria Reagent procedure")。对样本的稳定使细菌的GX裂解有多种可选的实验方案:酶裂解、机械破碎或两种方法结合使用。我们推荐使用TissueLyser II进行GX的机械破碎。然后将乙醇加入裂解液中以提供理想的结合条件。裂解液加到RNeasy硅胶膜上(结合能力达100 µg RNA)。RNA结合到膜上后,所有污染物被GX洗去。可用30–100 µl水洗脱得到浓缩的纯RNA。RNeasy Protect Bacteria Mini Kit可在QIAcube全自动核酸纯化仪上实现自动化。
由于物种和生长状况不同可能导致从细菌中分离的RNA产量不同。RNeasy Protect Bacteria Mini Kit适用于各种细菌,包括革兰氏阳性菌(如Staphylococcus aureus和Mycobacterium avium)和革兰氏阴性菌(如Escherichia coli和Salmonella typhimurium)。生长在限制或完全培养基中的细菌均可使用。由于RNeasy操作流程能纯化大于200 nt的RNA,得到的RNA中不包含5S rRNA、tRNAs和其他低分子量RNAs。RNeasy Protect Kits提供Z高品质RNA,几乎无DNA残留。对微量DNA非常敏感的RNA应用,残留的DNA可在RNeasy操作流程中使用RNase-Free DNase Set方便地进行DNase柱上处理。
Applications
使用RNeasy Protect Bacteria Mini Kit纯化的RNA非常适用于多种应用。下游应用包括:
Northern印迹、点印迹和狭缝印迹
终点法RT-PCR
定量real-time RT-PCR
芯片分析
Features | Specifications |
应用 | PCR, qPCR, real-time RT-PCR, microarray |
洗脱体积 | 30–100 µl |
规格 | Spin column |
主要样本类型 | Bacteria |
处理 | Manual (centrifugation) |
纯化总RNA、miRNA、poly A+ mRNA、DNA或蛋白 | RNA |
样本量 | 15 –100 µg |
稳定 | Yes |
技术 | Silica technology |
每次运行或制备时间 | 20 minutes |
产量 | 8–70 µg |