SILAC(定量蛋白质组学)
一、SILAC(定量蛋白质组学)原理:
SILAC ( Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture)技术是利用哺乳动物细胞增殖对必需氨基酸(Lys,Arg等)的依赖性原理而设计的代谢标记蛋白质的方法。以Lys为例,普通的Lys分子中有6个12C原子,用13C替代普通Lys中的全部12C原子,从而生成13C标记的Lys。13C标记的Lys要比普通的Lys多6Da。
比如两组细胞,一组用含普通Lys的培养基培养(记为K0),一组用含13C的Lys培养(记为K6)。由于Lys是细胞增殖的必需氨基酸,在细胞培养过程中13C标记的Lys自然“掺入”到新和成的蛋白质中,导致整个细胞的蛋白质组被13C标记的Lys所标记。鉴于K0和K6两个氨基酸存在6Da的质量差异,所以在后续LC-MS/MS对蛋白质进行分析时,能同时完成样品中蛋白质的鉴定和定量(6Da的质量差异)。根据定量结果,能直接判断蛋白质表达水平差异、区分特异性和非特异性相互作用等。
二、SILAC(定量蛋白质组学)特色:
(1、进行 细胞中 蛋白质相互作用和 蛋白质表达差异的定量蛋白质组学技术;
(2)通过LC-MS/MS分析,能 同时实现对未知样品中蛋白质分子的 鉴定与定量;
(3)依据定量结果,能直接判定蛋白质表达水平差异、区分特异性和非特异性相互作用等。
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