RNA pull-down：RNA-蛋白质互作_详细资料

产品信息

服务名称： RNA pull-down：RNA-蛋白质互作提供商：上海普赛生物科技有限公司

RNA pull-down+MS：lncRNA-蛋白质互作整体解决方案
一、简介：

lncRNA（Long Non-Coding RNA）被发现在肿瘤发生、免疫应答、机体发育等众多病理、生理过程中发挥重要作用，使得其成为近年来研究的热点。

通过高通量的 lncRNA-seq 等手段从样本中高通量的筛选差异表达的 lncNRA，然后「聚焦」一个/几个差异的 lncRNA，对其进行深入的生物学功能和分子机制的解析，是发表较高水准学术文章的常规思路。

“聚焦”分析一个 lncRNA，要做的实验总体有两个大方向的内容：（1）功能实验。通过干扰（RNAi、knockout）和过表达（over-expression）结合下游的生物学实验手段，解析目的lncRNA的具体生物学功能。（2）分子机制。即发现与目的 lncRNA 的互作蛋白（lncRNA interacting/binding proteins），通过互作的分子机理解析其生物学效应。

技术上，高通量筛选和发现lncRNA的特异性互作蛋白，RNA pull-down结合质谱（Mass Spectrometry，MS）是目前主流的技术。上海普赛生物科技有限公司通过技术研发，开发了两种基于质谱（MS）的lncRNA-互作蛋白筛选技术方案：（1）lncRNA pull-down：RNA-蛋白质互作定性解决方案；（2）SILAC+lncRNA pull-down：RNA-蛋白质互作定量解决方案。

二、lncRNA pull-down：RNA-蛋白质互作定性解决方案：

普赛生物：“从基因到互作”的整体技术解决策略：
Fig.1. 普赛生物lncRNA pull-down+MS的整体性技术流程。图中展示的实验结果均为普赛生物lncRNA pull-down策略的研发数据。

普赛生物lncRNA pull-down技术助力发表的代表性文章：

Cancer discovery 2016, 6(7):784-801. (IF=19.78)

三、SILAC+lncRNA pull-down：RNA-蛋白质互作定量解决方案：

SILAC+lncRNA pull-down整体技术解决策略：

Fig.2. SILAC+lncRNA pull-down整体实验流程。图中展示绿色原点是通过MS定量获得的、目标lncRNA的特异性互作蛋白（几十个），箭头所指（红色）的一个蛋白，为验证了的目标lncRNA的特异性互作蛋白（SILAC H/L ratio=1.98）。该研究工作刚被Nature Communications接收。

SILAC: Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture。 点击获知更多SILAC技术详情。

将SILAC技术和lncRNA pull-down结合，利用SILAC技术引入到蛋白质上的质谱标签（mass tag）实现对pull-down样品中的蛋白质定量，从而快速锁定lncRNA的特异性相互作用，极大的提高后续pull-down结合western blot验证的阳性率。

普赛生物的SILAC+lncRNA pull-down技术方案，能从lncRNA的编码基因开始，直至给出验证阳性的lncRNA特异性互作蛋白的整体技术解决能力。

四、更多互作蛋白质组服务：
（一）SILAC+IP-MS：蛋白质-蛋白质互作定量筛选整体解决方案
（二）SILAC+IP-MS（平价版）：
（三）SILAC+IP-MS（293T）：
（四）IP-MS（平价版）：
（五）IP-MS（293T）：
（六）lncRNA pull-down：lncRNA-蛋白质互作定性筛选整体解决方案
（七）SILAC+lncRNA pull-down：lncRNA-蛋白质互作定量筛选整体解决方案
（八）SILAC+DNA pull-down：DNA-蛋白质互作定量筛选整体解决方案
（九）SILAC+SM(small molecule) pull-down：小分子-蛋白质互作定量筛选整体解决方案

更多技术方案及我司数据展示，请访问我司官网：www.psi-bioscience.com.

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