地衣形芽孢杆菌染料法荧光定量PCR试剂盒
中英文名称 |
规格 |
价格 |
说明书 |
Bacillus licheniformis
地衣形芽孢杆菌染料法荧光定量PCR试剂盒 |
50次 |
2490元 |
咨询 |
运输:低温
保存:负20度
有效期:一年
货期:2-3周 |
产品及特点
1. 即开即用,用户只需要提供地衣形芽孢杆菌染料法荧光定量样品。
2. 根据地衣形芽孢杆菌染料法荧光定量保守序列设计的专一性引物,与相关地衣形芽孢杆菌染料法荧光定量无交叉反应。
3. 灵敏度可以达到几百拷贝/反应。
4. 一管式荧光定量PCR检测,避免后续污染。
5. 本试剂盒足够50次20μL反应体系的荧光定量PCR。
本产品只适用于科研,不能用于临床诊断。
规格及成分
成分 |
编号 |
十孔盒包装 |
2×qPCR MagicMix |
试剂一 |
500μL(棕色管) |
荧光PCR专用模板稀释液 |
试剂二 |
1 mL(黄盖) |
地衣形芽孢杆菌染料法荧光定量PCR引物混合物 |
试剂三 |
100μL(白盖) |
地衣形芽孢杆菌染料法荧光定量PCR阳性对照
(1×10E8 拷贝/μL) |
试剂四 |
50μL(红盖) |
使用手册 |
试剂五 |
1份 |
实验操作
1. 模板制备(样本制备区)
建议使用配套水生动物病害基因组 DNA/RNA 提取试剂盒系列产品,具体过程详见产品说明书。
2.添加模板(模板添加区,放置于冰盒中进行)
请于-20℃条件下保存,有效期 12 个月
取出所需测试数的已含有反应液 A-TSV-I 的 PCR 管,将试剂完全解冻,离心 30 秒,在管盖上标记管名(阴性对照管 NG、样品 XX、阳性对照管 PG)。打开管盖向各管管底分别加入 0.8μL B-I 及 0.2μL R-I,盖上阴性对照管管盖,其他各管分别沿管壁加入 2μL 模板,顺序为待测样品模板、PG-TSV-I,依次盖好各管管盖,离心 30 秒,立即进行扩增反应。
3. 扩增反应(扩增及产物分析区)
①恒温仪器 63℃条件下反应 60 min。待仪器升温至 63℃后,新建程序,设置实验名称及反应时间,将步骤 2中离心后的 PCR 反应管放入恒温荧光分子检测仪,点击开始检测。
②若使用荧光定量 PCR 仪,则荧光基团选择 FAM,淬灭基团选择 None,将 63℃ 15 s,63℃ 45 s 作为一个循环,于 63℃ 45 s 处收集荧光信号,60 个循环。
其他仪器请参照仪器说明书进行设置。
设置qPCR反应(20 μL体系,在样品制备室进行)
10. 如果只做1次重复,则标记N+9个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照,6个用于PCR阳性对照。如果做2-3次重复,则反应设置数量相应增加2或3倍。
11. 在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后加):
成分 |
样品管
N+2个 |
PCR阴性对照管 |
PCR阳性
对照管(2-7管) |
2×qPCR MagicMix
(棕色管) |
10 μL |
10 μL |
各10 μL |
地衣形芽孢杆菌染料法荧光定量引物混合液(白盖) |
2 μL |
2 μL |
各2 μL |
自备10×ROX (见注) |
2 μL |
2 μL |
各2 μL |
N+2待测样品DNA模板 |
6 μL |
不加 |
不加 |
第7步所得PCR阳性对照
稀释液(2-7号) |
不加 |
不加 |
各6μL(2号样到2号管,3号样到3号管…) |
盖上盖子后上机,按下面参数进行PCR(具体PCR参数可以根据仪器不同而自行优化)。
过程 |
温度 |
时间 |
预变性 |
92℃ |
5分钟 |
PCR反应
(30个循环) |
92℃ |
60 秒 |
54℃ |
60 秒 |
72℃ |
60 秒 |
数据处理
.如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品DNA浓度的log值,再推算出其浓度。
如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照Ct必须大于或等于40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于或等于30。对待测样品,如果其Ct大于或等于40则为阴性,如果小于或等于35则为阳性。如果在35-40之间,则重复一次。重复实验的Ct值如果大于或等于40则为阴性,如果小于40,则为阳性。
分区之间Z好进行物理性隔离,避免人为因素造成的污染。
2.实验过程中穿戴工作服和乳胶手套,不同区域独立使用工具,需更换手套和实验服。
3.严格按照操作步骤操作,试剂配制和加样等步骤请严格按照说明书要求在冰盒上操作。
4.反应液中的成分对光敏感,应避光保存。试剂使用前要完全解冻,但应避免反复冻融,推荐使用前离心 30秒。
5.反应结束后,扩增管请置于密封袋内丢弃,当日清理,开盖易造成气溶胶污染,禁止开盖。
6.不同批号试剂请勿混合使用,在有效期内使用。
反应五要素:
参加PCR反应的物质主要有五种即引物、酶、dNTP、模板和Mg2+
引物:引物是PCR特异性反应的关键,PCR 产物的特异性取决于引物与模板DNA互补的程度。理论上,只要知道任何一段模板DNA序列, 就能按其设计互补的寡核苷酸链做引物,利用PCR就可将模板DNA在体外大量扩增。设计引物应遵循以下原则:
①引物长度: 15-30bp,常用为20bp左右。
②引物扩增跨度: 以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。
③引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC*随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。
④避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是3'端的互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异的扩增条带。
⑤引物3'端的碱基,特别是Z末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致PCR失败。
⑥引物中有或能加上合适的酶切位点, 被扩增的靶序列*有适宜的酶切位点, 这对酶切分析或分子克隆很有好处。
⑦引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其它序列无明显同源性。
引物量:每条引物的浓度0.1~1umol或10~100pmol,以*引物量产生所需要的结果为好,引物浓度偏高会引起错配和非特异性扩增,且可增加引物之间形成二聚体的机会。