测量单粒种子2D&3D表型特征,并实现种子处理自动化过程
主要功能
• PhenoSeeder可以对不同大小不同形态的种子进行深入的综合型研究分析。
• 可分别对单粒种子进行2D或3D成像及分析,之后将种子进行播种或存储。
• 成像模块相互独立,模块化配置。
• 还可进行单粒种子称重。
PhenoSeeder的组成与工作流程示例图
系统组成
• Pick-and-place机械臂:吸附单粒种子,分别进行后续的2D或3D成像及分析,之后将种子进行播种或存储 。
• 2D成像工作站/3D成像工作站:相互独立,模块化配置 。
• 精密天平:主要进行单粒种子称重。
测量参数
• 通过2D成像获取的参数有:投影面积(mm2)、投影得到的长度(mm)、宽度(mm)、种子体积(mm³)
• 通过3D成像获取的参数有:3D重建得到的种子体积(mm³)、长度(mm)、宽度(mm)、高度(mm)
• 单粒种子质量(mg)、种子密度(质量/体积,mg mm-3)、种皮颜色
系统优势
• 模块化和灵活的系统,可以实现附加设备或传感器(更多成像模块在开发进行中)。
• 下游分析,例如通过Germination Scanalyzer进行发芽分析;使用PhenoCenter进行表型分析实验。
• 直接种植经过表型鉴定之后的种子。
参考文献
Jahnke S, Roussel J, Hombach T, Kochs J, Fischbach A, Huber G, Scharr H (2016)phenoSeeder -A Robot System for Automated Handling and Phenotyping of Individual Seeds. Plant Physiology 172:1358–1370.
Roussel J, Geiger F, Fischbach A, Jahnke S, Scharr H (2016) 3D Surface Reconstruction of Plant Seeds by Volume Carving:Performance and Accuracies. Front. Plant Sci. 7:745.