探针捕获技术
探针捕获测序是常用的目标区域基因检测方案,该方案基于多因素算法对目标区域基因组进行设计,然后合成出有效的特异性探针, 进而与基因组DNA进行杂交,将目标区域序列进行捕获并富集后,使用主流的illumina测序平台进行高通量测序。 通过对大量样本的目标区域研究,有助于发现和验证疾病相关的目标基因和关键位点,在临床诊断和药物开发方面有着巨大的应用空间, 同时在农业领域相关研究中也有巨大的应用潜力。
液相捕获
操作简单,对仪器设备要求低,可在几个小时内完成目标序列富集和测序文库构建,特别适用于临床检测。
![](http://item.yiqi.com/pic/ConPic/5/2017110311110931931.png)
固相捕获
![](http://item.yiqi.com/pic/ConPic/5/20171103111332843284.jpg)
捕获探针定制化流程
![](http://item.yiqi.com/pic/ConPic/5/20171103110659685968.jpg)
捕获探针性能指标
Sample |
Aligned(%) |
Initial bases on target |
Coverage of target region |
Fraction of effective bases on target |
Average sequencing depth on target |
Fraction of target covered with at least 10X |
Fraction of target covered with at least 20X |
1 |
98.8 |
483292 |
100.00% |
40.10% |
237.32 |
100.00% |
99.80% |
2 |
99.4 |
483292 |
100.00% |
40.10% |
219.48 |
100.00% |
99.70% |
3 |
98.81 |
483292 |
100.00% |
40.10% |
202.02 |
99.99% |
99.70% |
4 |
98.85 |
483292 |
100.00% |
40.10% |
237.56 |
99.99% |
99.70% |
5 |
98.4 |
483292 |
100.00% |
40.10% |
230.67 |
99.99% |
99.70% |
送检样本要求
样品类型 |
样品规格 |
样品采集/运输 |
DNA(新鲜/冰冻样品) |
>1.0μg,浓度>20ng/μl |
干冰运输 |
血液(全血) |
>1ml |
EDTA抗凝,2-8 °C冷藏运输 |
新鲜组织 |
>500mg |
低于-20 °C(干冰)冷冻运输 |
唾液 |
>1ml |
唾液保存液混合可室温运输,直接收集唾液需冷冻运输 |
ctDNA |
>1ml |
要求血浆,干冰运输 |
FFPE |
>1.5μ,浓度>20ng/μl |
干冰运输 |
细胞 |
>8×106 |
去除培养液,PBS清洗1次后液氮速冻,干冰运输 |
石蜡切片 |
>5片 |
10×10mm面积,常温运输,穿刺组织>10片 |
石蜡包埋块 |
>1块 |
不小于1×1×1mm常温运输 |
单细胞 |
>8×106 |
液氮速冻,干冰运输 |
我们的优势
1、的特异性。
2、的覆盖率和均一性。
3、的重现性:重复试验间的差异率不到10E-5。
4、可以精确地检测SNP等常见突变类型。
5、捕获效率高。
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