文章案例:为了研究晚期喉癌组织中lncRNA和mRNA的异常表达,我们利用lncRNA和mRNA整合芯片筛选了9对原发性IVA期喉癌组织和癌旁组织的lncRNA和mRNA表达谱,发现1459个差异表达的lncRNAs和2381个差异表达的mRNA,其中包括846个上调的lncRNAs和613个下调的lncRNAs,1542个上调的mRNAs和839个下调的mRNAs。对差异lncRNA和mRNA进行共表达分析,加上生信预测miRNA-mRNA及lncRNA-miRNA关系,ZH构建出ceRNA网络,筛选核心lncRNA-miRNA-mRNA。后期采用qRT-PCR方法进一步验证。这项实了lncRNAs和mRNAs是晚期喉癌的潜在生物标志物,可用于未来的进一步研究。(芯片检测+数据分析由中康博提供)
参考文献: Ling Feng et al. Integrated Analysis of Long Noncoding RNA and mRNA Expression Profile in Advanced Laryngeal Squamous Cell Carcinoma. Plos one. 2016.