Illumina Miseq二代基因测序仪
技术特性:
·现有NGS平台中最短的实验周期:从样品制备开始只需要8小时即可得到超过100M的高质量测序结果。
·现有NGS平台中较便捷的样品制备流程:只需50ngDNA模板,2小时的自动化操作就可以完成全部样品制备工作。
·现在NGS平台中较精确的测序原理:MiSeq继续GA和HiSeq平台的边合成边测序的化学原理,数千篇高质量的国际期刊文章是对Illumina NGS平台测序结果可信度较有力的证明。
·现在NGS平台中最完整的整合功能:MiSeq可以独立完成簇生成,双向测序及数据分析工作,让经费和实验室空间不再成为NGS研究的障碍。
最短的时间内获得答案,智能化的工作流程,广泛的测序应用范围
Illumina公司推出的MiSeq是一台在单个仪器上整合了扩增、测序和数据分析的新一代测序仪,每次运行能产生超过1 Gb的数据,且占地面积仅为2平方英尺。MiSeq有着革命性的流程和无可比拟的准确性,这让它成为快速且经济GX的遗传分析的理想平台,适合广泛的应用。同时根据Illumina的消息,今年9月份左右,MiSeq系统的测序通量将会升级至7G左右。升级将通过两个方面完成,一个是cluster密度的增大,升级后cluster密度将会增加至12-15million,而pair-end读取的reads数目将会增加至24-30million;另一方面是通过测序读长而提升通量,届时测序读长会达到2*250bp,同时测序速度也会有所提升。目前,Broad研究院已经利用现有试剂实现了单端测序300bp读长,Illumina目前内部测序更是完成了2*400bp的pair-end测序。而这些,都是保证在高质量数据结果的前提下完成的。
MiSeq性能参数
读长 | 测序时间 | 数据量 | 数据质量 |
1×35bp | 4小时 | >120 M | >90%数据高于Q30 |
2×100bp | 19小时 | >680 M | >80%数据高于Q30 |
2×150bp | 27小时 | >1 GB | >75%数据高于Q30 |
Illumina Miseq二代基因测序仪
四大特性
1、最短的实验周期:从样品制备开始只需要8小时即可得到超过100M的高质量测序结果。
2、较便捷的样品制备流程:只需50ngDNA模板,2小时的自动化操作就可以完成全部样品制备工作。
3、较精确的测序原理:MiSeq继续GA和HiSeq平台的边合成边测序的化学原理,数千篇高质量的国际期刊文章是对Illumina NGS平台测序结果可信度较有力的证明。
4、最完整的整合功能:MiSeq可以独立完成簇生成,双向测序及数据分析工作,让经费和实验室空间不再成为NGS研究的障碍。
应用范围
1、转录组测序
派森诺MiSeq测序平台是基因组已测序物种的转录组分析平台。公司技术团队目前已完成了包括斑马鱼在内的多种植物、动物的转录组测序及分析。
2、宏基因组16S rDNA单V区测序
对16s rDNA的单V区(V3V4)进行高通量测序,鉴定细菌群和古生菌群。派森诺的技术团队使用Illumina MiSeq测序16S rDNA V4区并结合Roche 454 FLX+测序16S rDNA V1~V3区成功的对鸡的肠道环境细菌进行了鉴定。
3、Small RNA测序
1*35bp的读长*地配合了小RNA的测序长度,速度快,灵敏度高。派森诺的技术团队目前已完成了鹅的小RNA测序和多种中草药的小RNA测序。
4、重测序:
包括全基因组重测序、简化基因组测序、外显子测序。
Illumina MiSeq非常适用于对微生物基因组的重测序,每次运行即可完成一个微生物基因组测序。2011年12月27日,派森诺的技术团队利用MiSeq一次运行同时完成了乳酸菌
(Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8)的重测序,基因组覆盖深度为分别为404倍和213倍,比对至参考序列,基因组覆盖率为100%,同时检测到了多种结构变异,包括插入、缺失和SNP位点,并且检测到了全部质粒。