SHERLOCK全自动微生物鉴定系统——细胞脂肪酸图谱鉴定
SHERLOCK® Microbial Identification System为美国MIDI公司依据自20世纪60年代以来对微生物细胞脂肪酸的研究经验,开发的一套根据微生物中特定短链脂肪酸(C9-C20)的种类和含量进行鉴定和分析的软件,该软件可以操控Agilent公司的6850和6890型气相色谱,通过对气相色谱获得的短链脂肪酸的种类和含量的图谱进行 比对,从而快速准确地对微生物种类进行鉴定。
系统特点:
1、迄今为止微生物鉴定系统中Z大的菌库
2、全细胞的脂肪酸抽提便利,使用常规试剂,成本低廉
3、纯培养后只需微量样品即可进行抽提和分析
4、气相色谱在分析大量样品时全自动,速度快,精度高
5、脱氧核糖核酸库(DNA Libraries)通过细菌的16S rRNA或真菌/酵母菌的28S rRNA测序结果与Sherlock DNA软件库中进行比对,并且将DNA与脂肪酸结果合并成一份整合性报告
并拥有21种细菌(生物)武器数据库
6、2001年在美国成功鉴定炭疽病例细菌在一步皂化过程即被杀灭,整个试验过程安全可靠 鉴定结果: Library Generation System (LGS)
通过LGS用户可以建立自己的数据库
可对发现的新种与已知菌种进行同源性分析
具有菌种追踪功能
脂肪酸鉴定与传统微生物鉴定方法的比较:
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脂肪酸鉴定方法
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传统方法
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操作过程
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将菌分为噬氧,厌氧及酵母在对应培养条件下培养一定时间(24-48h),通过2小时的脂肪酸抽提工作后,进行气相色谱,全自动分析,得到结果。操作简单
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需先将菌分为革兰氏阳性及阴性,并判断球、杆菌,在分型培养后,需多耗一天时间进行培养来得到菌的碳源利用率。操作复杂
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消耗品
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普通试剂,易保存
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用量大,价格贵,不易保存
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人为判断
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鉴定过程无需人为判断
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容易误判
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经典案例:
1、2001年11月在美国成功鉴定炭疽病例
2、2004年获得AOAC ial Methods of AnalysisSM(美国分析化学家组织 分析法)
3、美国联邦调查局(FBI)和美国国家环保署(EPA)用该方法检测可能
4、军事医学科学院与江苏省疾病控制ZX联合用该方法进行了《人源和猪源猪链球菌的同源性研究》
应用领域(国内用户):
疾病预防与控制(疾病控制ZX)
水质监测(国家海洋局)
土壤微生物检测(农林系统)
医院临床微生物鉴定(三甲医院)
出入境检验检疫(政府执法机构)
微生物分析研究(科学院和大学)
食品、药品企业(工业系统)
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国外部分用户:
美国疾病预防控制ZX
美国典型培养物保藏ZX(ATCC)
美国国家环保署(EPA)
美国农业部、国防部
澳大利亚科学与工业研究院(CSIRO)
英国国家工业、食品、海洋微生物研究ZX
英国阿斯利康制药(Astra Zeneca)
惠氏
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产地;美国