GRSAM-13:自然选择分析: 多样性与分歧进化 自然选择可以通过以下方式影响基因周围区域DNA变异的水平:(1)非常具有危害性的突变会被自然选择快速地消除;(2)具有微弱有害的突变可能分散于群体中,但是很少被固定存留下来;本分析模块可以探索基因周围区域的杂合度多样性模式,分析基因结构序列上不游区域的多样性(Diversity,包括Watterson’s θ,Tajima’s π)与分歧(divergence);根据基因型计算基因结构序列上的多样性程度,即杂合度(heterozygosity);也可分析编码转录本的起始/终止位置临近区域的多样性和进化分歧度;
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全基因组重测序
全基因组重测序是Z全面完整获取待研究物种样本基因组结构信息的研究策略。它可以获取全部基因组变异体结构,包括点突变SNP/短插入缺失(indel),基因组重排导致的结构变异(SNV),拷贝数变异(CNV), 杂合性缺失(LOH),重复区段(SD),以及重组热点区域(Recombination Hot spots)等基因组特征和规律。基于精确稳定的Hiseq2500高通量测序平台,凭借多年稳定信息学研究分析经验,惠研生物(BioGenius)可利用基因组测序数据进行重排突变和基因组结构功能分析; 全基因组关联分析与数量性状(QTL)分析;并可整合多方面基因组学数据做关联分析,包括转录组学数据,表观组数据等,可配合比较基因组学,群体遗传学分析技术,进化分析和计算生物学分析方法深入探索感兴趣的科学问题。
全基因组适用于:
- 基于家系遗传病研究;
- 复杂疾病研究;
- 基因组进化,
- 种群体遗传学与性状连锁等研究。
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http://www.biogenius.cn/htm/products/genomics/wgs/analysis/257.html
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- 全基因组测序/外显子组, 转录组等项目共计 完成近万个样本的测序与分析服务
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