GRSAM-08:病原体-宿主基因组整合分析 本模块将针对特定病原体与宿主基因组整合事件进行深度分析,例如HBV病毒整合嵌合于宿主基因组。本方案将针对病原体(病毒)整合位点的功能与上下游基因表达情况,以及表观标记的动态性改变,或者基因组结构的重组率,DNA复制速率以及其他染色体结构不稳定性指标进行数据整合分析,探讨病毒宿主整合基因组对宿主基因组,转录组,表观组甚至免疫组的改变、扰动。
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全基因组重测序全基因组重测序是Z全面完整获取待研究物种样本基因组结构信息的研究策略。它可以获取全部基因组变异体结构,包括点突变SNP/短插入缺失(indel),基因组重排导致的结构变异(SNV),拷贝数变异(CNV), 杂合性缺失(LOH),重复区段(SD),以及重组热点区域(Recombination Hot spots)等基因组特征和规律。基于精确稳定的Hiseq2500高通量测序平台,凭借多年稳定信息学研究分析经验,惠研生物(BioGenius)可利用基因组测序数据进行重排突变和基因组结构功能分析; 全基因组关联分析与数量性状(QTL)分析;并可整合多方面基因组学数据做关联分析,包括转录组学数据,表观组数据等,可配合比较基因组学,群体遗传学分析技术,进化分析和计算生物学分析方法深入探索感兴趣的科学问题。
全基因组适用于:
- 基于家系遗传病研究;
- 复杂疾病研究;
- 基因组进化,
- 种群体遗传学与性状连锁等研究。
更多详情:http://www.biogenius.cn/htm/products/genomics/wgs/analysis/253.html
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