microRNA测序
1、可进行任何物种的microRNA序列测定—不需要前体序列信息或是二级结构信息。
2、全基因组范围——研究样品中任意大小、已知或未知的所有microRNA。
3、数字化转录本表达分析——可准确定量表达水平跨越5个数量级的转录本丰度。
4、检测罕见转录本和转录变异体,如单核苷酸突变(SNP)。
我们的全方位服务
赛拓生物利用Solexa/Illumina高通量测序技术,为客户提供microRNA发现服务。利用该技术,我们可以对您样品中的所有microRNA进行全面覆盖、高灵敏度和高特异性的发现与序列测定。
我们的服务是全方位的——从样品到数据报告,凭借先进的技术和多年的经验为您提供Z有效的microRNA发现和序列测定。
我们 “从总RNA到数据报告” 的全方位服务包括:样品质控,样品制备(small RNA筛选,文库制备,单分子克隆扩增),高通量测序,生物信息学分析,以及出具报告。
样品多路技术——我们可以标记您的small RNA样品,然后在测序通道内将多个样品混合实验。在样品准备过程中加入的标注充当着“条形码”的作用,因此在数据分析过程中能够由得到的读数(reads)推断出特定样品。对于未知的样品,以标准测序起始是非常有效的。得到数据之后,您可以评估能否进行有标注和条形码的深度测序,充分发挥测序技术全容量的优势。
现在,赛拓生物同时推出靶向特异性样品富集服务。通过富集您的样品,可以进行更专注的测序,获得更深的覆盖。
您也可以利用定制微阵列分析服务对鉴定的microRNA(或其它客户定义的靶microRNA)进行表达谱分析。
Data Analysis / Results
通常我们会在收到客户总RNA样品4周后反馈。对于每个分析样品,客户将会收到:
1、完成pipeline分析,生成FASTA-A或FASTA-Q文件,提供碱基测定(basecalling)质量分数(quality score)
2、检测序列列表
3、每条序列的拷贝数
4、多个数据点的in-depth分析(可选)。可选的数据分析包括差异表达分析,t-test,ANOVA,错误发现率(FDR)计算,聚类分析。