提供Label-free 蛋白质组学非标记定量技术服务

◆ 研究背景
定量蛋白质组学，近年来获得了巨大的技术进步，主要体现在各类高分辨率质谱在蛋白质组学中的应用。以质谱为基础的定量蛋白质组学，主要可以分成两类，是稳定同位素标记的定量蛋白质组学，比如SILAC 和iTRAQ；另一类是非标记的定量蛋白质组学技术，比如使用Maxquant 软件进行的非标记蛋白质组学分析。我们运用Maxquant软件，采用基于图像方式简化大量LC-MS数据分析，并对肽和蛋白质进行相对定量。实验证明此技术具有较好的定量准确性和可信性。
◆ 蛋白质组学非标记定量分析的特点
1. 对液相色谱串联质谱的稳定性和重复性要求较高
2. 无需昂贵的同位素标签做内标，实验耗费低
3. 对样本的操作较少，并且不受样品条件的限制，克服了标记定量技术在对多个样本进行定量方面的缺陷
4. 可以检测到的肽段的动态范围可以达到4个数量级以上，提高了低丰度蛋白质的检测效率和非标记定量准确性
◆ Maxquant软件非标记定量分析的原理
Maxquant软件对液相色谱串联质谱数据非标记定量分析是以MS1为基础，将质谱数据由谱峰形式转化为直观的类似双向凝胶的图谱，谱图上每一个点代表一个肽段，再比较不同样本相应肽段的强度，从而对肽段对应的蛋白质经行相对定量。

◆ 分析流程
样品经Trypsin 酶切，酶切产物由高精度质谱Q Excative（Thermo Scientific）分析，分析数据由Maxquant软件进行分析。



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