连锁分析芯片是进行疾病连锁分析的工具,可以从家系基因型表现型和单基因型连锁不平衡中发现连锁关系。目前有人类及小鼠共4款芯片可选择。
HumanLinkage-24 Beadchip每张芯片可检测24个样品,覆盖6090个SNP位点,位点信息来源于HapMap数据库,两个SNP平均间距441Kb。人类连锁分析芯片成功率为99.8%,重复性>99.9%。
HumanLinkage V Panel Set该芯片覆盖染色体区域内6056个SNP标记,两个SNP 标记平均间距482Kb,用于检测重组。经过8个欧裔家系样本的检测证明Linkage V Panel 涵盖了全基因组中93.7%的信息,在任何一个染色体的区域的信息量都不会低于81%。
Mouse LD LinkageZ适合N2和F2 小鼠株系,对于其它任何株系或杂交系有平均85%的覆盖度。377个位点,基因组中每27Mb约有4个SNPs,并均匀覆盖了整个基因组。
Mouse MD LinkageBeadchip主要在10种Z常用的小鼠纯株系基因组总挑选出来的,1449个位点,密度为5Mb大约3个SNP,并均匀覆盖了小鼠的整个基因组。