伯豪生物细胞遗传学研究全面解决方案

方案一、利用SBC-Affymetrix平台使用Affymetrix SNP 6.0芯片进行全基因组拷贝数变化及LOH研究

    传统的细胞遗传学方法，如核型分析、显带技术等，都受到分辨率和覆盖率的限制，以致于无法全面地发现可能的异常。基于生物芯片技术的新方法，具有高分辨率的全基因组覆盖度，能极为准确且精密地检测各种大小的拷贝数变异。

    上海伯豪生物技术有限公司/生物芯片上海国家工程研究ZX（简称SBC）为您提供的基于Affymetrix平台的细胞遗传学解决方案通。使您可在整个基因组中同时检测由扩增、缺失或单亲二体型引起的微观和亚微观的变异。从而极大地增强您的细胞遗传学研究能力，充满信心地去寻找新的发现。

Affymetrix SNP 6.0芯片将是您进行细胞遗传学研究的理想工具!

Affymetrix SNP 6.0 芯片内容：

        Affymetrix Genome-Wide SNP 6.0芯片产品的涵盖超过1,800,000个遗传变异标志物：包括超过906,600个SNP和超过946,000个用于检测拷贝数变化的探针；

• 482,000个SNPs来自于前代产品500K和SNP5.0芯片；
• 424,000个SNP包括了来源于国际HapMap计划中的标签SNPs，X，Y染色体和线粒体上更具代表性的SNPs,以及来自于重组热点区域和500K芯片设计完成后新加入dbSNP数据库的SNP；
• 202,000个用于检测5,677个已知拷贝数变异区域的探针，这些区域来源的于多伦多基因组变异体数据库。该数据库中的每个3,182个非重叠片断区域分别平均用61个探针来检测；
• 744,000个探针平均分配到整个基因组上，用来发现求知的拷贝数变异区域。
  

具体应用：除了进行拷贝数研究外，还为基因分型和LOH研究提供帮助，从而能够进行：

UPD检测、亲子鉴定、异常的亲代起源分析（针对UPD和缺失）、纯合性分析、血缘关系鉴定。

应用案例：

近年使用Affymetrix SNP 芯片发表的文章

具体请参见Affymetrix SNP芯片应用案例（/newscontent.asp?id=743&sortid=132）

方案二、 利用SBC-Agilent平台使用Agilent aCGH进行拷贝数变化研究

    比较基因组杂交芯片（Comparative Genomic Hybridization Array）、基于芯片的比较基因组杂交（Microarray-based comparative genomic hybridization）或者阵列比较基因组杂交技术（array comparative genomic hybridization, array CGH）能在全基因组水平、高分辨率基础上检测染色体拷贝数的变化。

    基于基因芯片的比较基因组杂交技术, aCGH（array-based Comparative Genomic Hybridization）是一种突破性平台，这种平台能够支持研究人员通过微阵列准确研究与疾病有关的染色体的变化，大大促进实验方法改进和科研成果的获得。作为疾病的一项生物标志，染色体水平的缺失、扩增等变化已成为科学家研究的热点。以往科学家运用传统的染色体核型分析方法（如染色体区带染色分析，FISH等）已获得许多染色体结构变异的可贵进展。但传统的方法存在实验操作繁琐，分辨率低，不能覆盖全基因组等缺陷，难以提供染色体变异位点的精确定位。SBC的aCGH技术服务平台就解决了以上的难题。

Agilent aCGH将是您进行细胞遗传学研究的理想选择!

    Agilent aCGH的探针覆盖所有基因组，在包括基因区域（内含子区、外显子区）、基因间区域以及对疾病研究极其重要的亚端粒区域（除重复序列外）的分布大致相同。因此，利用此平台进行CGH分析具有敏感度高、精确度高、分辨率高（平均分辨率6.4kb）的特点，同时还可检测固定的石蜡样品，实验数据可信度高，仅需0.5ng基因组DNA即可进行实验。

产品及服务优势：

        Agilent推出的aCGH技术与其他类似产品不同的是，其产品是根据aCGH实验技术要求专一设计，而非用其他表达谱或SNP芯片替代。其探针设计覆盖人的全基因组，兼顾基因表达区和非表达区，对已知的疾病相关基因更是进行高密度覆盖，您可以方便地在一次实验中对全基因进行高分辨“扫描”，清晰地捕获疾病和正常样品的差异点。专一化设计的分析软件提供严格的统计分析以避免实验误差、多种实验数据的显示方式方便科学家对数据进行分析和归类。

   上海伯豪生物技术有限公司/生物芯片上海国家工程研究ZX（简称SBC）作为Agilent在ZGSJ也是WY一家认证服务ZX为您提供整套实验服务。仅需500ng的基因组DNA即可进行直接标记实验，无需对基因组DNA样品进行复杂性减除或扩增放大等预处理，因而使整个实验流程简便易行并减少了人为误差，尤其方便了临床科研起始样品量有限的研究需求。

    而且，您在全基因组筛选的基础上，可以对特定的染色体的局部区域进行更深一层的研究。通过eArray免费在线访问Agilent覆盖全基因组的800万已验证的aCGH探针库，SBC亦可帮助您设计符合您研究目的的芯片，其分辨率可达200bp, 比传统技术分辨率高出几千到几万倍。结合Agilent的基因表达谱芯片数据，您更可以从DNA和RNA两个层次全面了解疾病发SF展的生物学特性，其信息可相互验证和互补，为了解疾病的生物机理，建立临床诊断和ZL新方法，开发疾病ZL新药物等研究提供有力的帮助。

SBC服务内容：

方案三、利用SBC-Illumina平台定制SNP芯片
 

    人类全基因组计划完成后，多个国家合作（美国，英国，日本，ZG等）启动了一项后续计划，人类单体型计划(HapMap计划)，这个计划的目的就是研究SNP位点和疾病的关系，旨在建立一个人类健康、疾病以及对药物和环境因子的个体反应差异相关的基因公用数据库。这一性计划有70%的数据就是在GoldenGate®这个专利技术平台上产生的，其中ZG科学家承担了共10%的工作，这中间95%工作都是在国家人类基因组南方研究ZX的Illumina GoldenGate®技术平台上完成的（见Nature2005年10月封面文章）。

    上海伯豪生物技术有限公司/生物芯片上海国家工程研究ZX（简称SBC）与国家人类基因组南方研究ZX携手成立了上海南方基因科技有限公司，利用Illumina平台，为您提供定制SNP芯片服务。

          利用 Illumina GoldenGate^TM定制SNP芯片

实验者可以完全根据研究需要挑选SNP位点，制做探针组(OPA)，来进行分型研究。它适用于多
种研究如各种疾病的连锁分析或关联分析；禽畜的育种分型；其他物种（如微生物，植物等等）的遗传学研究等。每个样品了同时检测96,384-1536个SNP位点。

GoldenGate

          利用 Illumina iSelect定制SNP芯片

完全根据研究需要挑选SNP位点进行研究。每张芯片可平行做12个样品，每个样品可检测7,600 -60,800 个SNP位点。