转录组是细胞表型的关键决定因子,以往通过对大量细胞进行平均测量来了解细胞转录组的结构和功能的研究方法掩盖了细胞间的可变性,阻碍我们在分子层面上确定异质性的本质。但是任何组织或细胞培养中细胞间的差异是其生物状态和功能的基本特征,这是理解生物复杂性的基础。
10x Genomics单细胞转录组测序,通过微流体芯片将单个细胞分配到单个油包水液滴中,在单个液滴中进行反应。同时可以获得1000-10000个细胞的表达信息,从而实现对细胞群体的划分与细胞群体间基因表达差异的检测,是肿瘤细胞异质性、免疫细胞群体检测以及胚胎发育研究的黄金方法。
2018年11月,晶能生物率先开办10x Genomics单细胞转录组测序分析培训班,只需2天,就让你全面了解10x单细胞的技术原理、样本准备、数据分选、单细胞文章常见图形制作。培训概况主办单位:晶能生物技术(上海)有限公司
培训地点:上海市徐汇区漕宝路401号3号楼4B-晶能生物
培训时间:2018年11月24日-11月25日课程概况培训目标:1. 掌握10x Genomics单细胞转录组测序技术原理
2. 了解10x Genomics单细胞转录组测序样本准备
3. 拿到基因表达矩阵能画出单细胞文献常见图
培训内容:1. 10x Genomics技术理论介绍:技术原理、下机数据分选、案例解析2. 10x Genomics实验:样本准备(细胞悬浮液的制备、质控等)
3. R语言制图基础:
>>理论培训:R的语法、数据结构
>>R实战:R包安装、火山图/热图的绘制
4. 基于Seurat的10X单细胞3'表达谱的数据处理
>>质控, t-SNE和聚类
>>如何定义细胞类型
>>数据可视化包括热图, 小提琴图, t-SNE图和拟时轨迹图
培训费用2800 元/人(含学费、资料费、培训期间午餐费)
注:上机学员自己携带笔记本电脑(win系统,4G及以上内存),可协助安装软件。