外显子组测序
产品简介
外显子组是一个物种基因组中全部外显子区域的总和,它是基因行使其功能Z直接的体现。外显子组测序(Exome sequencing)是利用探针杂交富集蛋白编码区域DNA序列,通过高通量测序,发现与蛋白质功能变异相关的遗传突变。相比于全基因组重测序,外显子组测序更加经济、GX。
产品
优势
1. 直接对蛋白编码序列进行测序,找出影响蛋白结构的变异;
2. 高深度测序,可发现常见变异及频率低于1% 的罕见变异;
3. 针对外显子组区域测序,约占基因组的1%,有效降低费用,周期和工作量,更适用于大样本量疾病及癌症样本分析。
生物信息分析内容
基本分析1.原始数据的处理和质控
2.参考基因组序列对比
3.SNP和InDel变异识别
4.基因变异注释
高级分析
1.多样本数据合并和筛选
2.已知数据库过滤
3.编码区域和剪接位点区域变异筛选
4.基因变异类型筛选
5.基金功能注释和通路分析
个性化分析
1.连锁分析(限家系样本)
2.新生突变分析(限家系样本)
3.显隐性模式筛选(限遗传病)
4.变异显著性分析(限case/control样本)
5.基因功能富集
6.蛋白质网络分析
7.蛋白质结构分析
8.剪接位点变异预测
9.高频变异位点和基因统计