组织cDNA芯片8联管版免费SY_详细资料

产品信息

提供商：上海芯超生物

一、10款免费SY产品（冰冻样本的RNA反转录成cDNA点在8联管内，可用于常规PCR实验。）：

产品编码 器官点数 病例数 点样量 产品说明 备注

MecDNA-HEsoS008PG01 食管癌 8点 8例 20ng/点食管鳞癌8例：癌1点检测mRNA的表达

MecDNA-HStmA008PG01 胃癌 8点 8例 20ng/点胃腺癌8例：癌1点检测mRNA的表达

MecDNA-HColA008PG01 结肠癌 8点 8例 20ng/点结肠癌8例：癌1点检测mRNA的表达

MecDNA-HLivH008PG01 肝癌 8点 8例 20ng/点肝细胞肝癌8例：癌1点检测mRNA的表达

MecDNA-HLugC008PT01 肺癌 8点 8例 20ng/点肺癌8例：癌1点检测mRNA的表达

MicDNA-HEsoS008PG01 食管癌 8点 8例 20ng/点食管鳞癌8例：癌1点检测miRNA的表达

MicDNA-HStmA008PG01 胃癌 8点 8例 20ng/点胃腺癌8例：癌1点检测miRNA的表达

MicDNA-HColA008PG01 结肠癌 8点 8例 20ng/点结肠癌8例：癌1点检测miRNA的表达

MicDNA-HLivH008PG01 肝癌 8点 8例 20ng/点肝细胞肝癌8例：癌1点检测miRNA的表达

MicDNA-HLugC008PT01 肺癌 8点 8例 20ng/点肺癌8例：癌1点检测miRNA的表达

二、组织cDNA芯片
组织cDNA芯片(Tissue cDNA Array)[1-3]是采用病理学家验证过的人类癌症组织及配对癌旁组织制备的均一化的cDNA阵列，是一种通过实时荧光定量的方法来检测目的基因的表达的cDNA阵列,许多文献中使用了该工具[4,5]。
组织cDNA芯片可以直接用于实时荧光定量PCR（qPCR），来检测编码RNA（mRNA）和非编码RNA( lncRNA, microRNA 及circRNA)的表达情况。主要用于在大量样本中筛查不同疾病阶段组织间单个基因表达差异，更能反应人类疾病机制。qPCR通常被用来验证基因芯片结果的可靠性[6]。

三、组织cDNA芯片8联管版使用说明

验证引物特异性
引物设计的好坏往往很大程度上决定了qPCR实验结果的好坏，所以建议在进行正式实验之前先通过少量样本进行预实验来验证引物特异性，组织cDNA芯片8联管版正是为预实验所设计的，预实验结果是这样，那么引物特异性OK

评价目的基因在组织中的表达水平
qPCR的实验结果一般以Ct值体现，当Ct值越大，则表明目的基因的表达水平越低，反之，Ct值越小，则表明目的基因的表达水平越高。组织cDNA芯片8联管版可以初步预估目的基因在组织中的表达情况。

四、组织cDNA芯片原理：
可以概括为以下几个步骤：
1、选取病理学家验证过的人类癌症组织及配对癌旁组织；
2、进行RNA抽提，并质检RNA抽提结果；
3、选择抽提合格的RNA反转录成cDNA；
4、将均一化的cDNA均一的铺在96孔板上，冷冻干燥。

五、组织cDNA芯片应用范围

已经获得潜在的生物标志物且在相对较少的样本中验证成功，需要扩大样本量来进一步验证以获得统计相关性；

已经在细胞系或者模式动物中验证过的生物标志物，需要在临床样本中验证其临床诊断和ZL的意义；

生物标志物需要验证在不同临床分期中的表达及临床意义；

已经在某种肿瘤中验证过有临床意义的生物标志物，希望在其他肿瘤中进行验证。许多基因在一种癌症类型中表达失调，往往在其他肿瘤中也会表现表达失调或突变。例如BRCA1突变（乳腺癌易感基因）除了与乳腺癌相关外，也被发现在其他肿瘤中，例如卵巢癌、输卵管癌、前列腺癌和结肠癌等。

参考资料：
1、http://med.wanfangdata.com.cn/Paper/Detail/PeriodicalPaper_JJ0212107204
2、http://www.360doc.com/content/18/0510/16/19913717_752763118.shtml
3、http://www.superchip.com.cn/biology/cdna.html
4. Zhao W, Lu D, Liu L, Cai J, Zhou Y, et al. (2017) Insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 3 (IGF2BP3) promotes lung tumorigenesis via attenuating p53 stability. Oncotarget 8: 93672-93687.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29212181
5. Young HL, Rowling EJ, Bugatti M, Giurisato E, Luheshi N, et al. (2017) An adaptive signaling
network in melanoma inflammatory niches confers tolerance to MAPK signaling inhibition. J Exp Med 214: 1691-1710.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28450382
6. Git A, Dvinge H, Salmon-Divon M, Osborne M, Kutter C, et al. (2010) Systematic comparison of microarray profiling, real-time PCR, and next-generation sequencing technologies for measuring differential microRNA expression. RNA 16: 991-1006.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20360395

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产品编码	器官	点数	病例数	点样量	产品说明	备注
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