高通量转录组测序技术,无需了解物种基因信息,能够对任意物种进行转录组分析,并接测定每个转录本的片段序列,精确到单核苷酸的分辨率;动态达6个数量级,能够同时鉴定和定量稀有转录本和正常转录本,以及检测基因家族中相似基因和可变剪接造成的不同转录本的表达;被广泛的应用于转录本结构研究(基因边界鉴定、可变剪切研究等),转录本变异研究(如基因融合、编码区SNP研究),基因表达水平研究以及全新转录本发现。
生物信息学分析模块
RNASeq-C01 | 测序质量评估(QC) |
RNASeq-C02 | 模式动植物基因组数据和注释信息整合 |
RNASeq-C03 | 测序短序列统计匹配(Read Mapping)与数据统计 |
RNASeq-C04 | 转录组表达量的计算 |
RNASeq-C05 | 基因表达差异分析 |
RNASeq-C06 | 差异基因生物学通路分析(代谢通路/信号通路) |
RNASeq-C07 | 差异基因 GO功能注释 |
其他 | |
样品要求
1)样品类型:细胞、新鲜组织或RNA样品。
2)样品的量:细胞样品请提供至少1×107个细胞,组织样品请提供至少300mg的组织块或切片,RNA样品请提供10 μg以上的总RNA。
3)样品质量:RNA无明显降解,提取的总RNA OD260/280值在1.8~2.2之间,浓度 ≥ 500 ng/μl,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥ 8。
4)样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成~50mg的小块)可用TRIZOL或RNA保护剂处理或液氮冻存后,-80℃保存。RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。
5)样品运输:样品置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰运输。