lncRNA-seq

1. 技术稳定，建库重复性好：同一样本重复建库相关性Pearson值大于0.993；
2. 基于高通量测序技术，可一次性获得样本中几乎全部的lncRNA信息；
3. 不局限于对已知lncRNA的研究，还可进行novel lncRNA的预测；
4. 除人和鼠外，还可应用于其他真核物种，可共同制定定制化研究方案。

技术参数

一、样品要求

                                                        表1 样品质量判定标准

说明：

Level A：A类样品，指的是质量满足建库测序要求，且总量可以满足2次或者2次以上建库需要的样品。

Level B：B类样品，指的是质量满足建库测序要求，且总量可以满足1次但不足2次建库需要的样品。

二、项目运转周期

标准流程的运转周期约为60个工作日（20对以上样本需额外增加时间）。

三、项目合格指标

产生不低于合同规定的clean data。
 

2. 定制化信息分析（需要mRNA表达量数据，并且需要根据样本数量等进行评估）

　　1）CNC（coding-non-coding）共表达注释；

　　2）Pathway富集分析；

　　3）结合客户的需求，协商定制其它定制化信息分析内容。

样品要求
 
1）样品类型：细胞、新鲜组织或RNA样品。
2）样品量：细胞样品请提供至少1×10^7个细胞，组织样品请提供至少300mg的组织块或切片，RNA样品请提供10 μg以上的总RNA。
3）样品质量：RNA无明显降解，提取的总RNA OD260/280值在1.8~2.2之间，浓度≥ 500 ng/μl，28S:18S ≥ 1.5，RIN ≥ 7。
4）样品保存：细胞样品或新鲜组织块（切成~50mg的小块）可用TRIZOL或RNA保护剂处理或液氮冻存后，-80℃保存。RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。
5）样品运输：样品置于1.5 ml管中，封口膜封好，干冰运输。