无标记(label-free)相对定量蛋白质组学鉴定

简介:
定量蛋白质组学方法包括标记和非标记两大类。常见的标记方法如SILAC, iTRAQ, TMT等，无标记方法如使用Maxquant软件进行分析。Maxquant软件非标记定量分析是以MS1为基础，实验证明结合Maxquant软件分析的非标记技术具有较好的定量准确性和可靠性。可以利用无标记蛋白质组学方法对各类复杂样本提取蛋白及co-IP、Pull-down等中等复杂样本进行蛋白鉴定与定量。对于复杂样本蛋白鉴定数量通常在1千个以上。
◆ 蛋白质组学非标记定量分析的特点
1. 对液相色谱串联质谱的稳定性和重复性要求较高
2. 无需昂贵的标记试剂
3. 对样本的数量无限制，克服了标记定量技术在对多个样本进行定量方面的缺陷


质谱鉴定实验流程(溶液内酶解)
 

使用仪器
Thermo Scientific Q Exactive （高分辨质谱）

 
技术优势
复杂样本蛋白和中度复杂蛋白样本均可以，如各类样本提取蛋白或相互作用的蛋白质洗脱液； 高准确性， 高灵敏度。
 
实验报告内容
1、差异蛋白结果（excel 列表）；差异蛋白归类(GO和KEGG分析)。
2、完整的实验步骤、使用仪器、试剂来源、软件检索参数等。
 
样品要求

样品	样品要求
蛋白质溶液	蛋白质总量>10μg，浓度>0.5μg/μl； 说明裂解液成分，浓度信息等

                                 
实验样本预处理及运输注意事项
为保证高质量的技术服务结果，请您参照以下说明对实验样本进行处理和保存：
⊙蛋白质溶液：定量并计算总蛋白量，密封好管口，干冰包装寄送。

特别提醒：快递寄送样本运输过程中，可能晃动幅度会比较大，请做好基本运输防护措施。
注：在寄送样本时，请填写好样本登记表，随样本一同寄往本公司。
 
 
服务收费：

1. 3000元/样品 (检测一次，如样品数量较多，可申请特殊优惠)

 

1. 实验周期：

样品数目	2-6个	7-10个	10个以上
实验周期	3 weeks	4 weeks	5 weeks

参考文献：
Zhang, B., et al. (2014) Proteogenomic characterization of human colon and rectal cancer. Nature 513, 382-387

Matthew J.Rardin,et al. (2013) Label-free quantitative proteomics of the lysine acetylome in mitochondria identifies substrates of SIRT3 in metabolic pathways. PNAS vol.110, no.16, 6601-6606