制浆和造纸工业中常常用氯来进行漂白，将对环境造成一定的破坏。而木材半纤维素主链中的两种基本成分是木聚糖和葡甘露聚糖，木聚糖酶能够水解木聚糖，它能增强纸浆纤维的多孔性，有利化学药品的渗透，从而提高木质素的提取率，用少量的氯来达到漂白效果。借助木聚糖酶来帮助造纸工业中的漂白是一种低投入，经济且环保的方法，在1987年就有研究者证实了木聚糖酶能够降低环境污染药物在造纸工业中的用量；用来自耐热嗜碱芽孢杆菌的木聚糖酶先处理甘蔗渣后，漂时过氧化氢的用量减少10卡帕，并且亮度增加了2.5%。
在谷物细胞壁中含有阿拉伯木聚糖等抗营养因子，从而会影响家禽对营养的吸收。木聚糖酶伴随着葡聚糖酶、果胶酶、纤维素酶、蛋白酶、淀粉酶、植酸酶等运用于动物饲料中，这些酶能够破坏阿拉伯木聚糖等抗营养因子的完整性，从而减小原材料的粘度，促进动物对饲料营养物质的消化吸收。研究发现：在以玉米-豆粕-杂粕型为基础日粮，分别在基础日粮上添加250g/t和500g/t的木聚糖酶，结果整个阶段的肉鸭生长增重分别比对照组增加了2.77%和4.96%，料重比分别下降了1.85%和2.11%，得出使用木聚糖酶对肉鸭的生产性能有一定的提高。通过在日粮中加入阿拉伯木聚糖酶来研究仔猪生理生化指标变化情况，得出在日粮内添加阿拉伯木聚糖酶能提高断奶仔猪的日增重，并且影响仔猪生长性能和相关血液的生化指标。
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