PCR 反应的影响因素
通用型 RT-LAMP 试剂盒50 次供应变性温度与时间:
模板变性温度是决定 PCR 反应中双链 DNA 解链的温度,达不到变 性温度就不会产生单链 DNA 模板,PCR 也就不会启动。变性温度低则变性不完全, DNA 双链会很快复性,因而减少产量。变性温度太高,又会影响酶的活性。一般情况 下可设为 94℃ 20~30 秒,高温时间应尽量缩短,以保持耐热 DNA 聚合酶的活力, Z高变性温度不宜超过 95℃。 退火温度与时间:退火温度决定 PCR 特异性与产量。温度高特异性强,但过高则引物 不能与模板牢固结合.
DNA 扩增效率下降;
温度低产量高,但过低可造成引物与模板 错配,非特异性产物增加。合适的退火温度一般在 45~68℃之间。设置特定反应的Z 适退火温度,可根据引物的(G+C)%含量进行推测,一般实验中退火温度比扩增引 物的熔解温度 Tm 低 5℃,退火时间一般为 30~60 秒,足以使引物与模板之间完全结 合,长时间退火没有必要。
延伸温度与时间:
PCR 反应的延伸温度一般选择在 70~75℃之间,延伸时间根据所用 聚合酶扩增速度和扩增片段大小设定,如同样扩增 2 Kb 片段,若使用 Taq 酶只需 1 分钟,使用 Pfu 酶则应设定 2 分钟以上。延伸时间过长会导致非特异性扩增带的出现, 时间太短则可能得不到扩增产物或得到一些短的非特异性片段。
循环次数:
可根据模板 DNA 的量、扩增片段的大小和扩增产物的下步应用等因素,设 定 20-40 个循环。循环次数太少,扩增量不足,如果循环次数太多,错配几率会增加, 非特异性背景严重。所以,在保证产物得率的前提下,应尽量减少循环次数。
酶量:
50 μL 反应体系可用 0.5-5 U 酶,酶量的选择与模板 DNA 的量,扩增片段大 小等有关,酶量过多易发生非特异性反应,而且可能增加突变的机率,尤其在进行高 保真扩增时,应尽量减少酶量,但酶量过少时反应性能下降。
通用型 RT-LAMP 试剂盒50 次供应产品及特点:
易错 PCR(error-prone PCR)是利用 Taq DNA 多聚酶不具有 3′→5′校对功能的特性,在一定条件下(如不同的 dNTP 浓度、Mg 浓度和 MnCl2存在)能够按较高的机率引入随机引入突变。如果有适当的选择方法,则可从构建的突变库选出所需突变体。易错 PCR 和常规 PCR 的比较如下:本产品就是专门为广大的研究工作者进行易错 PCR 而开发,本产品具有下列特点:
1. 即开即用,十分简单方便,尤其在生物制药和酶学研究领域显示出了它的优越性。
2. 配方经过精心优化,突变率稳定,突变没有趋向性。易错 PCR 的突变率为 0.66% (±0.13%),详见使用手册疑难解答。
3. 比体内基因突变更快捷简单,但如果在 PCR 引物中设计位点,则可使产物克隆到表达载体,也可以用于体内蛋白活性的筛选。
4. 可用于连续易错 PCR(sequential error-prone PCR),只需把上一次易错 PCR 的产物用作下一次易错 PCR 的模板即可,使每一次获得的小突变累积而产生重要的有益突变。
5. 只适用于扩增 1kb 以下的产物,对于 1kb 以上的产物,建议分段扩增。 注意:
1.如果反应体系不是 30 uL,各成分需要等按比例增加或减少。
2.如果 DNA 模板中有 PCR 不明YZ物(植物、土壤和血液等 DNA 样品常含此类 YZ物),可以在 PCR 体系中加入 1/10 的 PCR YZ物清除剂(CAT#:60804, 30uL 体系中加 3uL),可能会对 PCR 有帮助。使用方法:
1. 以 30 uL 的标准 PCR 反应体系为例,如果反应体系不是 30 uL,各成分需要等按比例增加或减少。在一干净的 PCR 管中,加入下列成分:易错 PCR Mix, 10× 3 uL 易错 PCR 专用 dNTP, 10× 3 uL MnCl2, 5 mM 3 uL 自备 DNA 模板(10ng/uL) 1 uL PCR 引物(自备,10 uM each) 10 pmol each Taq DNA 聚合酶(5U/uL) 1 -5 U 补水到 30 uL
2. 按已经优化的 PCR 条件进行一定循环数的 PCR(循环数与突变率的关系见下表),然后取 5 uL 电泳检查。如果没有优化的 PCR 条件,一般可以先尝试下面的 PCR 条件: PCR 前变性 94℃ 3 分钟易错 PCR 94℃ 1 分钟 45℃ 1 分钟 循环 30 次(见注) 72℃ 1 分钟注:易错 PCR 一般不需要热启动,也不需要在 PCR 结束后做延伸处理。
3. 电泳检测是否得到预计长度的 PCR 产物。
人脐带血单个核细胞 Human
T-110A透明质酸酶(含10mL酶解缓冲)1mL
成人心肌细胞 (HCMa) (1×106 )
小鼠瘤细胞;Fox-NY 小鼠肺大静脉平滑肌细胞完全培养基 100mL
正常大鼠肾细胞;NRK
SLAMF8 Others Mouse 小鼠 SLAMF8 / BLAME 人细胞裂解 (阳性对照) (变性)
小鼠肉瘤瘤株;S180
人胶质细胞(少突细胞)(HO) (1×106 )
原代表皮角化细胞特制无血清添加剂Many types of cells包装:1ml
人巨细胞白血病细胞株;Mo7e 大鼠卵巢上皮细胞完全培养基 100mL
H22 小鼠肝癌细胞
ERBB2 Others Rat 大鼠 ErbB2 / HER2 人细胞裂解 (阳性对照) (变性)
KIR2DL4 Others Human 人 KIR2DL4 / CD158D CHO细胞裂解 (阳性对照) (变性)
CL-0106HFL1(人肺成纤维细胞)5×106cells/瓶×2
人表皮色素细胞-浅色素裂解物HELM-l L
新生牛眼晶体上皮细胞;NBLE 人甲状腺癌细胞,SW579细胞 RIN-m5F细胞,小鼠β胰岛素瘤细胞
人膀胱上皮永生化细胞;SV-HUC-1
EPHA4 Others Human 人 EPHA4 人细胞裂解 (阳性对照) (变性)
CL-0106HFL1(人肺成纤维细胞)5×106cells/瓶×2
KIR2DL4 Others Human 人 KIR2DL4 / CD158D CHO细胞裂解 (阳性对照) (变性)
人表皮色素细胞-浅色素裂解物HELM-l L
新生牛眼晶体上皮细胞;NBLE 人甲状腺癌细胞,SW579细胞 RIN-m5F细胞,小鼠β胰岛素瘤细胞
人膀胱上皮永生化细胞;SV-HUC-1
EPHA4 Others Human 人 EPHA4 人细胞裂解 (阳性对照) (变性)
D/E中和琼脂250g用于卫生环境中微生物的分离培养
水稻赤霉菌培养基 250g 用于水稻中赤霉菌培养
改良V-P培养基 V-P Medium,Modified 250 用于蜡样芽孢杆菌的V-P试验(SN标准)
标准Ⅱ号营养琼脂250g/瓶用于培养非苛氧的细菌,也用于奶制品中细菌总数的测定incubationmedia标准Ⅱ号营养琼脂250g/瓶用于培养非苛氧的细菌,也用于奶制品中细菌总数的测定
伊红美蓝琼脂平板(9cm) 10个/包 弱选择性培养基、用于分离肠道致病菌,特别是大肠杆菌
伊红美蓝琼脂(EMB)22060250g用于分离革兰氏阴性肠道菌特别是大肠菌和粪大肠菌
葡萄糖胰蛋白胨肉汤 (CM0073) Oxoid incubation media 葡萄糖胰蛋白胨肉汤 (CM0073) Oxoid
诺尔斯氏链霉菌 模式菌株 支/瓶
ModifiedMacConkeyBroth
大豆-干酪素消化物培养基 250g 用于金黄色葡萄球菌的MPN测定,增菌培养,钠浓度可根据需要而调整
MZACAgar
25L incubation media 25L
抗生链霉菌 产磷酸二脂酸 支/瓶
VTMBroth
ColumbiaBloodAgarMedium
通用型 RT-LAMP 试剂盒50 次供应疱肉牛肉粒加入疱肉基础中,配成疱肉培养基
锰盐营养琼脂 Mn2+Nutrient Agar 用于嗜热需氧芽孢杆菌的检验
四环素检定琼脂 Tetracyline Examination Agar 250克 副溶血性弧菌的选择性分离培养
Andrade氏糖类肉汤250用于细菌的糖发酵试验incubationmediaAndrade氏糖类肉汤250用于细菌的糖发酵试验
磷酸盐缓冲液(pH7.2) 250g 用于样品的稀释