介绍
荧光定量PCR技术于1996年由美国Applied Biosystems公司推出,由于该技术不仅实现了PCR从定性到定量的飞跃,而且与常规PCR相比,它具有特异性更强、有效解决PCR污染问题、自动化程度高等特点,目前已得到广泛应用。 荧光定量PCR技术是通过荧光染料或荧光标记的特异性探针,对PCR产物进行标记跟踪,实时监控反应过程。随着PCR 反应的进行,反应产物不断累积,荧光信号强度也等比例增加。每经过一个循环,收集一次荧光强度信号,这样就可以通过荧光强度变化监测产物量的变化,结合相应的软件对产物进行分析,可以得到荧光扩增曲线,计算待测样品初始模版的量。实时荧光定量PCR技术是一次由定性技术向定量技术的飞跃,运用该项技术,可以对DNA、RNA样品进行相对定量、定量和定性分析。
检测分类
1. mRNA表达量水平检测:相对定量法。
2. MicroRNA表达量水平检测:通过设计特殊茎环结构的反转录引物,结合实时定量PCR可以精确检测微量样品中microRNA表达水平。内参基因一般用U6。
3. 基因拷贝数检测:如检测样品中不同细菌含量、基因工程菌目的基因拷贝数、环境中耐药基因检测等。采用定量法。
定量方式
1. 定量:用已知浓度的标准品绘制标准曲线,而后通过标准曲线对未知浓度的检测样品进行量(起始拷贝数)分析。
2. 相对定量:以内参基因为参照,比较两个或两个以上样本中某个基因表达量的变化,通常用来对mRNA表达量进行分析。一般采用2-ΔΔ Ct 法进行计算。每个样本重复三次。
检测方式
1. SYBR Green Ⅰ法:
在PCR反应体系中,加入过量SYBR荧光染料,SYBR荧光染料特异性地掺入DNA双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的SYBR染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与PCR产物的增加完全同步。
2. TaqMan探针法:
探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5’-3’外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物的形成完全同步。
样品要求
■ 须提供新鲜的足量材料(细胞数106个以上,组织100 mg以上),样品-70℃快递至本公司(干冰或液氮运送,以保证样品质量),亦可提供保证质量的DNA或RNA样品(2 μg以上);
■ 提供靶基因信息,包括基因序列或GenBank Accession Number等;
■ 提供详细的背景资料,生物物种信息(Human、Mouse、Rat等)、DNA/RNA来源、基因丰度等。
提供结果
引物和探针及序列,胶图,原始数据(包括扩增曲线和熔解曲线)、数据分析结果及实验报告。
检测周期
常规检测任务2-3周内完成,具体情况根据要检测的基因和样本数而定。