全宏基因组测序技术

产品提供商：易基因生物


服务名称：全宏基因组测序科研服务


由于扩增子测序技术关注的是目标基因的若干区域，因此其分辨率有限，一般认为较为准确的分类水平到属级别。虽然扩增子测序也可以通过数据库映射预测群落可能的功能网络，但是微生物遗传片段交流比较频繁，功能基因的横向转移也较为普遍，依托于有限菌株建立的功能映射无法尽可能的还原群落的真实功能网络。


原理：全宏基因组测序技术直接对提取的全宏基因组DNA建立随机小片段文库，能够获取更多的序列信息。通过组装、ORFs预测与注释，可以大大提高分类水平部分至菌株级别，并通过各种大型公共数据库进行相应功能注释，尽可能真实的获取群落功能网络信息。高精度的分析结果也使相关动物验证实验更加具备可行性。  

            
技术优势：




 

实验策略：










分析内容：


 

 
 
送样要求：

样本直接运输（干冰）：粪便≥1g；土壤、底泥等≥4g；水样需微孔滤膜过滤后送样； 拭子≥2个；
样品DNA运输 (干冰)：总量≥3μg，浓度≥30ng/μl，OD260/280 = 1.8~2.0；DNA 无明显降解，需提供凝胶电泳检测胶图；
测序策略：PE150；
其他注意事项：
① DNA量以我司的检测结果为准；
② 若DNA总量超过样品要求，可以进行样品保存；项目完成后，将不再保存剩余样品。
项目周期：15个样本以下标准运转周期 约为45个工作日，大样本量项目需分批建库，项目周期需要与技术支持人员确定。


研究案例：



 
 
 
 
易基因其他产品列表：

 

表 观 基 因 组 学	BS类	IP类	染色质类	转 录 组 学	sc RNA	微 生 物 组 学	Meta	多 组 学 分 析	scWGBS+scRNA
	WGBS	MeDIP	ATAC-seq		lncRNA		扩 增 子 测 序		LHC-BS+ssRNA
	scWGBS	hMeDIP			原核转录组
	RRBS/dRRBS	CHIP			有/无参考基因组
	oxBS	6mA			ceRNA
	ACE-seq	m6A
	LHC-BS