上海宏基因组测序实验外包

上海宏基因组测序实验外包

一、服务介绍
    宏基因组学研究不要求对每个微生物进行分离纯化培养，而是直接从样品中提取基因组DNA后进行测序分析。通过宏基因组测序，能够解释微生物群落多样性、种群 结构、进化关系、功能活性及环境之间的相互协作关系，地扩展了微生物学研究范围。环境微生物多样性检测是指通过对环境中微生物16S rDNA高变区/ITS 的PCR扩增产物进行高通量测序，分析该环境下微生物群落的多样性和分布规律。
二、操作流程
 1. 基因组DNA提取
 2. DNA随机打断
 3. 加测序街头、构建文库
 4. 上机测序
 5. 序列拼接
 6. 生物信息学分析
三、生物信息分析 
1. 物种鉴定
2. 多样性统计学分析
3. 宏基因组拼接
4. 功能分析
5. 微生物群落结构及功能
四、 上海宏基因组测序实验外包 样品要求
1. 样品类型：人体微生物的基因组DNA（双链DNA序列）。
2. 样品的量：构建小片段文库，DNA样品总量不低于5μg.
3. 样品质量：OD260/280值应在1.8～2.0 之间；样品的主带应在23kb以上，基因组无降解。
4. 样品浓度：样品的浓度越高越好，低不应低于50ng/μl.
5. 送样要求：寄送样品好保持低温环境，好的方法是冻干邮寄，其次是溶于TE，当然也可以溶于双蒸水，样品注明溶剂成分。
五、质量承诺
   提供可靠数据和分析结果