● Mouse ceRNA 芯片v1.0介绍
非编码RNA因在生命过程中起到非常重要的调控作用而越来越受到重视,lncRNA 、circRNA广泛参与了许多疾病的发SF展,系统地研究生物体内lncRNA 、circRNA 的功能和作用机制,有助于我们更加全面、深入地了解基因表达调控机理及生物体的生命活动。小鼠基因组与人类基因组高度同源,作为复制人类疾病动物模型和研究基因功能的模式动物,广泛应用于发育生物学、功能基因组学和疾病机制的研究领域。伯豪生物全国首推小鼠三合一芯片,涵盖mRNA、lncRNA、circRNA,让您一次实验就能够全面地分析整个转录组。
芯片特点:
稳定:芯片采用Agilent eArray平台设计,使用Agilent SurePrint技术合成,探针长60mer,检出率高,技术重复性高于99%;利用芯片碱基互补杂交的方式,能够比测序技术更灵敏、稳定地对表达丰度较低的circRNA、lncRNA进行检测。
超值:覆盖circRNA、lncRNA、mRNA,一份芯片数据同时提供三个层面的表达信息,circRNA和lncRNA作为典型的内源竞争性RNA,此款芯片可以让您畅游ceRNA调控研究。
高通量:包含41,960条circRNA,86,682条lncRNA、20,783条mRNA,让您的筛选范围更广;针对circRNA伯豪生物筛选、收集大量高水平文献及公共数据中的circRNA 。
特异性高:环状RNA -特异的反向剪接位点探针设计,保证每个探针检测的特异性,避免与母基因之间的冗余影响。
探针设计示意图:
芯片技术参数:
格式
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探针长度
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环状RNA数目
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lncRNA数目
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mRNA数目
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环状RNA探针策略
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4×180K
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60 nt
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41,960
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86,682
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20,783
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特异覆盖反向剪接位点 |
数据来源:
GENCODE /Ensembl(6,094)、lncrnadb (12)、Noncode v5 (80,101)、UCSC /NCBI(21,258)、circbase(9,365)、deepbase(379)、SBC(32,216) |