大鼠模型已被证明是研究生物分子相互作用和人类疾病的一种宝贵工具。大鼠基因组与人类基因组有类似之处,通过用一个改变的或失活的版本代替基因或使基因灭活,可方便地操纵大鼠基因以模仿人类疾病状态。
Affymetrix GeneChip® Rat Transcriptome Assay 1.0旨在加快人类疾病的临床前研究,并增加将大鼠模型中的发现结果转译到人类研究中的成功率。
RTA1.0芯片中,每个外显子约有10条探针,每个外显子-外显子剪接位点有4条探针。该分析可产生Z全面、准确和可再现的全转录组表达数据,并可灵活地选择所需的分析水平来解答您的生物学问题-包括基因水平、转录本水平、蛋白编码或非编码RNA水平,您可以随心所欲。
此外,RTA1.0芯片服务可以支持广泛的常见样本类型,包括新鲜和新鲜冰冻的组织、血液以及FFPE 样本。
服务特点:
芯片内容:
Array protein coding content
|
No.
|
Array non-protein coding content
|
No.
|
Gene (transcript clusters)
|
>25,000
|
Gene (transcript clusters)
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>61,000
|
Transcripts
|
>91,000
|
Transcripts
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>103,000
|
Exons
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>316,000
|
Exons
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>289,000
|
Exon clusters
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>229,000
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Exon clusters
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>230,000
|
芯片设计和注释数据库来源于数据库信息:RefSeq,Ensembl,Rat Genome Database (RGD),MGC Mammalian Gene Collection, NONCODE,lncRNA db,AceView, Chalmel F., et al. High-resolution profiling of novel transcribed regions during rat spermatogenesis. Biology of Reproduction 91(1):5 (2014).
每个外显子约有10条探针,每个外显子-外显子剪接位点有4条探针。该分析可产生Z全面、准确和可再现的全转录组表达数据,并可灵活地选择所需的分析水平来解答您的生物学问题-包括基因水平、转录本水平、蛋白编码或非编码RNA水平。
样品类型既包括新鲜冻存样品,也包括FFPE样本。