全基因组甲基化测序 (WGBS)-欧易生物_详细资料

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提供商：上海欧易生物医学科技有限公司服务名称：全基因组甲基化测序 (WGBS)

全基因组甲基化测序 (WGBS)
WGBS（Whole-genome bisulfite sequencing）被视为甲基化测序的“金标准”。其原理是用 Bisulfite 处理，将基因组中未发生甲基化的 C 碱基转换成 U，进行PCR扩增后变成T，与原本具有甲基化修饰的 C 碱基区分开来，再结合高通量测序技术，与参考序列比对，即可判断 CpG/CHG/CHH 位点是否发生甲基化，特别适用于绘制单碱基分辨率的全基因组 DNA 甲基化图谱。
欧易特色
可靠的建库质量
多年文库技术积淀，具有丰富的样品处理经验和建库经验
完善的质控过程
可以提供整套质控分析，确保数据准确性
丰富的基础分析内容
从各个层面综合解析 WGBS 数据
更个性化的生物信息分析服务
成熟的生物信息分析团队，熟悉各种分析算法和软件；
与客户充分互动，提供更多个性化分析思路和分析方案
可读性强的数据报告
提供多方面的数据及图形内容，同时撰写详细的软件使用手册，帮助客户更好地自行进行数据查看
推荐测序模式
● Hiseq X Ten，PE150 ● 30 X 基因组大小
常见问题
1.为什么 WGBS 所得的 raw data 产量和 Q30 比例较全基因组重测序的低？
因为在 WGBS 建库过程中，非甲基化的 C 会转化为 U（测序过程中呈现为 T），因此 WGBS 文库处于碱基不平衡的状态（read1 中 C 含量极低、read2 中 G 含量极低）。而 Illumina 测序仪在 cluster 定位过程中会过滤较高比例的 cluster，使得 raw data 产量降低；另外由于 GC 含量较低，测序过程中质量值也较容易下降。
2. 哪些因素会影响结果？
样品 DNA 质量、Bisulfite 处理过程、测序深度、测序质量等都会影响到ZZ的结果。
3.怎样保证 Bisulfite 对 DNA 处理的完全性？
目前我们建立了标准实验流程，确保 Bisulfite 对 DNA 的处理达到生物信息分析要求。我们的标准实验流程是在以标准品DNA 和 H19 等基因位点的多个质量控制步骤下进行严格控制的。

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