微生物多样性/扩增子测序
技术简介微生物扩增子测序主要通过直接扩增环境总 DNA 的特定区域,绕过微生物培养瓶颈,GX评估多样品环境微生物分布、丰度变化和群落组成情况。随着高通量测序技术的不断发展,微生物扩增子测序技术已成为环境微生物群落比较和差异分析的主流研究手段之一。
针对不同研究需求,一般选择扩增 16S 高变区来区分环境样品的细菌和古菌群落,ITS 区域扩增用以评估真菌群落,原生动物等为主的真核微生物群落研究可通过 18S 高变区测序来实现 。此外,也可通过特定的功能基因测序等来揭示特定功能相关的环境微生物群落分布。
技术路线 送样建议 浓度 (Qubit) | 体积 | 总量 | 基因组完整性 |
≥20ng/μL | ≥15μL | ≥0.3μg | DNA 无降解 |
*针对容易降解的样品推荐使用ZYMO RESEARCH的DNA/RNA保护剂进行保存,并且常温运输。技术参数 测序平台 | 测序策略 | 数据量 | 周期 |
Illumina MiSeq | PE300 | 20,000 raw tags | 30-40个自然日 |
*我公司还可提供宏基因组测序,全基因组高通量甲基化测序技术服务。