Solexa测序技术第二代分析系统Genome Analyzer IIx是当前世界上应用最为广泛的新一代测序系统,相对于传统测序的96道毛细管测序,高通量测序一次实验最多可以读取6000万条序列,具有高准确性、高通量、高灵敏度和低运行成本等突出优势。可以同时完成传统基因组学研究以及功能基因组学研究。为目前遗传分析和功能基因组等研究领域提出了全新的应用方案。
HiSeq2000既有Illumina和Solexa在边合成边测序上的优势,又融合了ZX的光学和系统设计。它能够在单次运行中产生200Gb的数据,每天能产生25Gb。该系统使用两个流动槽和一种新颖的双表面成像方法,能够使测序通量及实验灵活性提升到新的水平。
本公司能够根据客户的不同需求,基于多年基因组学研究经验及强大的生物信息学综合技术平台支持,为客户提供从制定研究计划到获得研究成果的全面解决方案。
●测序流程
基因组DNA的随机打断
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DNA片段的末端修复
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修饰,末端加上接头(adapter)
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PCR扩增连上接头的DNA片段
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文库检测
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DNA的成簇扩增
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上机测序
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生物信息组装/分析
基因组测序服务
全基因组重测序是对基因组序列已知物种的个体进行基因组测序,并在个体或群体水平进行差异性分析的方法。基因组的重测序可以辅助研究者发现单核苷酸多态性位点(SNPs)、拷贝数变异(Copy Number Variation, CNV)、插入(Insertion)、缺失(Deletion)等变异类型,这在人类疾病及动植物育种研究等方面均具有重大的指导意义。
De novo测序也叫从头测序,不需要任何基因序列信息即可对某个物种进行测序。用生物信息学的分析方法对测读序列进行拼接、组装,从而获得该物种的基因组序列图谱。 随着新一代测序技术的飞速发展,大大降低了基因组测序的成本和时间,为研究新物种全基因组序列提供了一个崭新的研究平台。
●结果提交
A: 原始数据报告,包含所有测序序列的序列信息,碱基读取质量评估
B: 基本数据分析报告(Excel表格),包含有效序列的序列信息
C: 高级数据分析(应客户要求定制)
(1)基因组组装:包括原始数据统计、覆盖度计算、组装结果相关统计;
(2)基因组组分分析:编码基因预测,以及基因功能预测;
(3)比较基因组分析:以客户提供的近源物种的序列为参考序列,进行SNP分析、共线性分析。
●服务说明
1.DNA样品OD260/280为1.8-2.0之间;样品浓度越高越好,不应低于30ng/ul,总量不低于20ug
2.基因组需保证完整,无明显降解,湿冰运送即可
3.近源物种的序列(如果存在近源物种完整的序列)