实验技术简介:微生物基因组De novo测序分析也叫微生物基因组从头测序分析,指不依赖于任何参考序列信息就可对某个微生物进行分析的测序分析技术,用生物信息学的方法进行序列拼接获 得该物种的基因组序列图谱,然后进行注释等后续一系列的分析。微生物Denovo基因组测序及分析技术可以应用于医药卫生等领域。
实验操作流程:
1、基因组DNA
2、文库构建
3、测序
4、数据分析
实验注意事项:
客户提供:
1、样品量:细胞样品请提供至少5×106个细胞,组织样品请提供至少100mg的组织块或切片。DNA样品请提供2μg以上的基因组DNA。
2、DNA样品:浓度≥200ng/ul,总量≥500ug.OD值在1.8-2.0之间,样品浓度越高越好;电泳检测无明显RNA条带,基因组条带清晰、完整。
3、 样品质量:DNA无明显降解,OD260/280值在1.7~1.9之间,浓度≥ 50ng/μl。请提供DNA样品具体浓度、体积、制备时间、溶剂名称及物种来源。请同时附上QC数据,包括电泳胶图、分光光度或Nanodrop仪器检 测数据。如需进行多次样品制备,需要提供多次样品制备所需样品。
4、样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成~50mg的小块)用液氮速冻后,-80℃保存。DNA样品可溶于的超纯水或TE(PH8.0)中,-20℃短期保存或者-80℃长期保存。样品保存期间避免反复冻融。
5、样品运输:细胞或组织样品置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰运输。DNA样本放离心管或者PCR板中,密封后,冰袋运输。
6、目的基因或转录因子的相关背景资料。
交付标准:
完整项目报告(材料、试剂、仪器、方法、数据分析、实验结果)
Tel:010-57425721/57425722 Fax:010-80780672
E-mail:lab-manager@jiamay.com
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400免费热线:400-0007-401
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