细菌小RNA(sRNA)是一类长度在50~300 nt的调控RNA, 与细菌生长、代谢、应激反应、致病性密切相关。细菌sRNA多通过与靶mRNA配对, 在转录后水平影响目标mRNA翻译或稳定性,影响细胞的多种生理功能。云序生物为客户提供一站式细菌小RNA测序服务,能够帮助客户识别新的细菌小RNA,解析细菌小RNA表达谱,预测细菌小RNA的靶基因,促进其功能和机制研究。
云序特色 - 适用的细菌种类全面:云序生物拥有市面上最全的去rRNA试剂盒,能够去除各类细菌样品中的rRNA,GX地检测小RNA分子
- 特异性富集小RNA:特异性富集50-300 nt的小RNA片段,sRNA有效数据比例高
- 链特异性检测:链特异性建库方案,可以准确检测反义sRNA
- 专业的生物信息学分析:强大的生物信息学团队,满足客户的各类深入数据分析需求
数据分析 基本分析 | 高级分析 |
1. 原始数据整理,过滤和质量评估 | CS-BSR-001. sRNA靶基因预测 |
2. 序列匹配与数据统计 | CS-BSR-002. sRNA靶基因的GO与信号通路分析 |
3. sRNA识别和注释 | CS-BSR-003. sRNA-靶基因相互作用网络 |
4. sRNA表达量计算 | |
5. 差异sRNA筛选 | |
6. sRNA表达聚类分析 | |
数据展示云序生物技术服务列表1. 测序服务 转录组 | 表观遗传组 | 基因组 |
真核生物 | 原核生物 |
miRNA测序 | 细菌sRNA测序 | (h)MeDIP测序 | 目标序列靶向测序 |
小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA) | 原核生物mRNA测序 | RRBS测序 | 外显子组测序 |
lncRNA测序 | 宏转录组测序 | 全基因组甲基化测序 | 人类基因组重测序 |
环状RNA测序 | 原核生物转录组测序 | ChIP测序 | 16S rDNA测序 |
mRNA测序 | 原核De novo转录组测序 | RNA pull down | 宏基因组测序 |
降解组测序 | | RIP测序 | |
转录组测序 | | RNA甲基化测序 | |
De novo转录组测序 | | | |
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2. 生信服务 & PCR技术服务 生信服务 | 实时定量PCR服务 |
转录组 | 表观遗传组 | 基因组 | 联合分析 |
环状RNA分析 | DNA甲基化分析 | 基因组分析 | circRNA-miRNA | 功能分型PCR芯片 |
lncRNA分析 | ChIP测序分析 | 微生物菌落分析 | LncRNA-mRNA | 环状RNA实时定量PCR |
mRNA分析 | | 宏基因组分析 | LncRNA-miRNA-mRNA | LncRNA实时定量PCR |
microRNA分析 | | | | miRNA实时定量PCR |
| | | | mRNA实时定量PCR |