BTN131036 5′末端同位素标记试剂盒

特别提示：包括5′末端同位素标记试剂盒在内，本公司的所有产品仅可用于科研实验，严禁用于临床YL及其他非科研用途！

产品名称：5′末端同位素标记试剂盒

英文名称：DNA 5′End-Labeling Kit

产品货号：BTN131036

产品规格：20次



本产品为DNA 5′末端标记系统，利用T4 Polynucleotide Kinase(T4多聚核苷酸激酶)和［γ-32P］ATP 对粘性末端或平末端的DNA或RNA的5′末端进行GX标记反应。原理如下：





产品特点：

1. 使用本试剂盒之前，不需要对 5′末端的磷酸基团进行去磷酸化处理，因为使用的kinase 能使5′末端的磷酸与[γ-32P]ATP的γ-磷酸进行交换。

2. 合成的单链或双寡核苷酸的5′末端游离的OH基团都能通过Kinase反应被标记(或者只是简单的磷酸化)。

3. 提供的两种反应液使交换反应和磷酸化反应都能GX进行，均能得到大于106 cpm/pmol(5′-end)的比活性。



试剂盒组份：

成分	规格
T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL)	20μl
5×交换反应缓冲液	100μl
10×磷酸缓冲液	50μl
Control DNA	20μl
说明书	1份

储存条件：低温运输，-20℃保存，有效期一年。



使用方法：



一、交换反应

1. 实验前需自备的试剂：7 M 醋酸铵、乙醇、70%乙醇等

2.在微量离心管中制备下列反应液：

成分	加入的体积
自备的5′磷酸化DNA片段	14μL(≤5 pmoles的5′末端)
5×交换反应缓冲液	5μL
[γ-32P]ATP	5μL
T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL)	1μL
灭菌的超纯水	补足到25μL

注：5 pmoles的5′末端约等于0.17μg的长100bp的双链DNA。

3. 37℃反应30分钟。

4. 70℃加热5～10分钟使酶失活。

5. 加入10μl的7 M CH3COONH4(pH4.5)。如使用CH3COONa做乙醇沉淀时使其终浓度达300mM。

6. 加入87.5μl(2.5倍)的冷无水乙醇，-20℃放置30～60分钟。

7.离心回收沉淀，用 70%的冷乙醇清洗沉淀，真空干燥。

8. 用适当 Buffer 溶解沉淀。

注：通过第5～8 步操作几乎可以除去大部分未反应的[γ-32P] ATP，如要完全将其除去时，乙醇沉淀后用凝胶过滤等方法精制即可。如需用苯酚抽提除去蛋白质时，请在第8 步之后进行。



二、磷酸化反应标记



A. 去磷酸化反应

1. 实验前需自备的试剂：TE 饱和酚/氯fǎng、3 M NaCl 、乙醇、70%乙醇、牛小肠碱性磷酸酶(CIAP)等

2.在微量离心管中制备下列反应液：

成分	加入的体积
自备的DNA片段	133μL(≤10μg)
1M Tris-HCl，pH8.0	15μL
牛小肠碱性磷酸酶(CIAP，10～20U/μL)	2μl
灭菌的超纯水	补足到150μL

3. 50℃反应30分钟。

4. 加入150μl的TE 饱和酚/氯fǎng/异戊醇(25：24：1)，充分混匀。

5.离心，取上层(水层)移到另一个微量离心管中。

6. 重复操作 4～5。

7. 加入7.5μl的3 M NaCl(zuì终浓度150mM)。

8. 加入375μl(2.5倍量)的冷无水乙醇，-20℃放置30～60分钟。

9.离心回收沉淀，用 1mL 70%的冷乙醇清洗后，沉淀真空干燥。

10. 使用 20μl的TE Buffer 溶解沉淀。



B. 磷酸化反应(前反应)

1.在微量离心管中制备下列反应液：

成分	加入的体积
自备的DNA片段	20.5μL(≤5 pmoles的5′末端)
10×磷酸缓冲液	2.5μL
[γ-32P]ATP	1μL
T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL)	1μL
灭菌的超纯水	补足到25μL

2. 37℃反应30分钟。

3.下面的操作与交换反应的第4-8 步操作相同。



三、合成DNA 寡核苷酸的标记

1.在微量离心管中制备下列反应液：

成分	加入的体积
Oligonucleotide DNA with free 5′-OH(5～10 pmoles)	≤3μL
10×磷酸缓冲液	2.5μL
[γ-32P]ATP	1μL
T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL)	1μL
灭菌的超纯水	补足到25μL

2. 37℃反应30分钟。

3.下面的操作与交换反应的第4-8 步操作相同。



四、合成DNA 寡核苷酸的标记

当掺入水平很低的时候，需要使用本步骤，即通过体积排阻色谱或过滤试剂盒除去未反应的标记。Sephadex G-50 层析柱(需另购)对于去除未掺入的dNTPs效果很好，它还能大幅减少小于20个碱基的DNA 寡核苷酸和小于20bp的双链DNA的量。使用之前需要在70℃加热5～10分钟以使T4 多聚核苷酸激酶失活。Sephadex G-25 层析柱可以用来纯化长度不小于10个碱基的寡核苷酸。



注意事项：

1.缓冲液可在室温融解。融解后立即置于冰中，使用前充分混匀。

2. 5×交换反应缓冲液于-20℃冻结保存时会有白色浑浊出现，但不影响反应效果。

3.酶切得到的DNA片段需经乙醇沉淀等方法纯化。

4. 当用于交换反应的DNA在5 pmoles以上(约1,000bp以上)时，标记效率有时会低于106 cpm/pmol。

5. 如果交换反应所用 DNA低于500bp时，标记效率有时会有所降低。

6. 若不进行放射线标记，仅使用本试剂盒做5′末端磷酸化反应时，反应体系中的［γ-32P］ATP可用5μl的10mM ATP 代替。

7. 磷酸化反应时的［γ-32P］ATP可用［γ-35S］ATP 替代。



使用举例：

按照使用方法中交换反应和合成DNA 寡核苷酸的标记的实验操作，取λ-BstP I，λ-Hpa I，λ-EcoT22 I 各3 pmols，用［γ-32 P］ATP 通过正向磷酸化反应或交换反应标记。各DNA片段的放射自显影结果如下所示：





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货号	名称	规格
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产品特点：

1. 使用本试剂盒之前，不需要对 5′末端的磷酸基团进行去磷酸化处理，因为使用的kinase 能使5′末端的磷酸与[γ-32P]ATP的γ-磷酸进行交换。

2. 合成的单链或双寡核苷酸的5′末端游离的OH基团都能通过Kinase反应被标记(或者只是简单的磷酸化)。

3. 提供的两种反应液使交换反应和磷酸化反应都能GX进行，均能得到大于106 cpm/pmol(5′-end)的比活性。



试剂盒组份：

成分	规格
T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL)	20μl
5×交换反应缓冲液	100μl
10×磷酸缓冲液	50μl
Control DNA	20μl
说明书	1份

储存条件：低温运输，-20℃保存，有效期一年。



使用方法：



一、交换反应

1. 实验前需自备的试剂：7 M 醋酸铵、乙醇、70%乙醇等

2.在微量离心管中制备下列反应液：

成分	加入的体积
自备的5′磷酸化DNA片段	14μL(≤5 pmoles的5′末端)
5×交换反应缓冲液	5μL
[γ-32P]ATP	5μL
T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL)	1μL
灭菌的超纯水	补足到25μL

注：5 pmoles的5′末端约等于0.17μg的长100bp的双链DNA。

3. 37℃反应30分钟。

4. 70℃加热5～10分钟使酶失活。

5. 加入10μl的7 M CH3COONH4(pH4.5)。如使用CH3COONa做乙醇沉淀时使其终浓度达300mM。

6. 加入87.5μl(2.5倍)的冷无水乙醇，-20℃放置30～60分钟。

7.离心回收沉淀，用 70%的冷乙醇清洗沉淀，真空干燥。

8. 用适当 Buffer 溶解沉淀。

注：通过第5～8 步操作几乎可以除去大部分未反应的[γ-32P] ATP，如要完全将其除去时，乙醇沉淀后用凝胶过滤等方法精制即可。如需用苯酚抽提除去蛋白质时，请在第8 步之后进行。



二、磷酸化反应标记



A. 去磷酸化反应

1. 实验前需自备的试剂：TE 饱和酚/氯fǎng、3 M NaCl 、乙醇、70%乙醇、牛小肠碱性磷酸酶(CIAP)等

2.在微量离心管中制备下列反应液：

成分	加入的体积
自备的DNA片段	133μL(≤10μg)
1M Tris-HCl，pH8.0	15μL
牛小肠碱性磷酸酶(CIAP，10～20U/μL)	2μl
灭菌的超纯水	补足到150μL

3. 50℃反应30分钟。

4. 加入150μl的TE 饱和酚/氯fǎng/异戊醇(25：24：1)，充分混匀。

5.离心，取上层(水层)移到另一个微量离心管中。

6. 重复操作 4～5。

7. 加入7.5μl的3 M NaCl(zuì终浓度150mM)。

8. 加入375μl(2.5倍量)的冷无水乙醇，-20℃放置30～60分钟。

9.离心回收沉淀，用 1mL 70%的冷乙醇清洗后，沉淀真空干燥。

10. 使用 20μl的TE Buffer 溶解沉淀。



B. 磷酸化反应(前反应)

1.在微量离心管中制备下列反应液：

成分	加入的体积
自备的DNA片段	20.5μL(≤5 pmoles的5′末端)
10×磷酸缓冲液	2.5μL
[γ-32P]ATP	1μL
T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL)	1μL
灭菌的超纯水	补足到25μL

2. 37℃反应30分钟。

3.下面的操作与交换反应的第4-8 步操作相同。



三、合成DNA 寡核苷酸的标记

1.在微量离心管中制备下列反应液：

成分	加入的体积
Oligonucleotide DNA with free 5′-OH(5～10 pmoles)	≤3μL
10×磷酸缓冲液	2.5μL
[γ-32P]ATP	1μL
T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL)	1μL
灭菌的超纯水	补足到25μL

2. 37℃反应30分钟。

3.下面的操作与交换反应的第4-8 步操作相同。



四、合成DNA 寡核苷酸的标记

当掺入水平很低的时候，需要使用本步骤，即通过体积排阻色谱或过滤试剂盒除去未反应的标记。Sephadex G-50 层析柱(需另购)对于去除未掺入的dNTPs效果很好，它还能大幅减少小于20个碱基的DNA 寡核苷酸和小于20bp的双链DNA的量。使用之前需要在70℃加热5～10分钟以使T4 多聚核苷酸激酶失活。Sephadex G-25 层析柱可以用来纯化长度不小于10个碱基的寡核苷酸。



注意事项：

1.缓冲液可在室温融解。融解后立即置于冰中，使用前充分混匀。

2. 5×交换反应缓冲液于-20℃冻结保存时会有白色浑浊出现，但不影响反应效果。

3.酶切得到的DNA片段需经乙醇沉淀等方法纯化。

4. 当用于交换反应的DNA在5 pmoles以上(约1,000bp以上)时，标记效率有时会低于106 cpm/pmol。

5. 如果交换反应所用 DNA低于500bp时，标记效率有时会有所降低。

6. 若不进行放射线标记，仅使用本试剂盒做5′末端磷酸化反应时，反应体系中的［γ-32P］ATP可用5μl的10mM ATP 代替。

7. 磷酸化反应时的［γ-32P］ATP可用［γ-35S］ATP 替代。



使用举例：

按照使用方法中交换反应和合成DNA 寡核苷酸的标记的实验操作，取λ-BstP I，λ-Hpa I，λ-EcoT22 I 各3 pmols，用［γ-32 P］ATP 通过正向磷酸化反应或交换反应标记。各DNA片段的放射自显影结果如下所示：