cDNA文库构建
定义:含一种生物体所有基因编码的cDNA分子的克隆群。以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。
一般实验过程:
1:反转录酶催化合成cDNA链
2:cDNA第二链的合成
3:cDNA的甲基化
4:接头或衔接子的连接
5:Sepharose CL-4B凝胶过滤法分离cDNA
6:cDNA与λ噬菌体臂的连接
注意事项:
1.RNA 的提取(例如异硫氰酸胍法,盐酸胍—有机溶剂法,热酚法等等,提取方法的选择主要根据不同的样品而定)。
2.要构建一个高质量的 cDNA 文库,获得高质量的 mRNA 是至关重要的,所以处理 mRNA 样品时必须仔细小心。
3.由于 RNA 酶存在所有的生物中,并且能抵抗诸如煮沸这样的物理环境,因此建立一个无 RNA 酶的环境对于制备优质 RNA 很重要。
4.文库构建要选择合适的载体,常规用的是 λ 噬菌体,这是因为 λ DNA两端具有由12个核苷酸的粘性末端,可用来构建柯斯质粒,这种质粒能容纳大片段的外源 DNA。
5.胶回收前电泳槽,电泳板,梳子等都要用1%的HCl浸泡过夜。
6.胶回收时电压要稳定。