实时荧光定量PCR(Real Time PCR,qRT-PCR)避免了传统PCR 以终产物检测定量产生的偏差,提高实验的重复性。与常规PCR 相比,实时荧光定量PCR 具有特异性更强、有效解决PCR 污染问题、自动化程度高等特点,已成为国际公认的核酸分子定量的标准方法。该技术已被广泛用于检测细胞mRNA 表达量的变化;比较不同组织的mRNA 表达差异;验证基因芯片,siRNA 干扰的实验结果。它涉及到DNA或RNA 样品制备,反转录及PCR 反应等一系列重要的分子生物学过程。
配套产品:qPCR实时荧光定量一步法试剂盒 BK2100BK BK2100
设计目的片段和内参基因的qPCR引物:利用Primer5.0等软件设计PCR引物及探针。我们公司免费为客户设计引物和探针。
SYBR Green 法
1)建立以下反应体系
试剂(SYBR Green法)量
总RNA 根据实验
qPCR mix(包含MLV、Hot-start Taq、dNTP等 ) 终浓度为1×
SYBR Green I solution 终浓度为1×
上游引物,10μM 终浓度:~200 nM
下游引物,10μM 终浓度:~200 nM
MgCl2 根据实验
RNase-Free H2O To 25.0 μl
2) PCR 反应条件如下:
步骤 循环数 步骤温度 时间
逆转录 1 1 42 oC 30 min
失活MLV,激活Taq 1 1 95 oC 10 min
1 95 oC 15 sec
2 X oC* 实时荧光定量PCR 40 30 sec
3 72 oC 30 sec
*与引物的Tm 相关
3) 取5μl PCR 产物跑1.5%琼脂糖凝胶电泳,或做溶解曲线,检测PCR 产物的特异
荧光图谱
Taqman 法
1) 建立以下反应体系
试剂(Taqman法) 量
总RNA 根据实验
qPCR mix(包含MLV,Hot-start Taq、dNTP等 )
终浓度为1×
Taqman Probe 根据实验
上游引物,10μM 终浓度:~200 nM
下游引物,10μM 终浓度:~200 nM
MgCl2 根据实验
RNase-Free H2O To 25.0 μl
2) PCR 反应条件如下:
步骤 循环数 步骤温度 时间
逆转录 1 1 42 oC 30 min
失活MLV,激活Taq 1 1 95 oC 10 min
1 95 oC 15 sec
实时荧光定量PCR 40
2 60 oC* 1 min
3实验完毕之后,将数据导入到Excel 中进行数据分析。
4.结果分析:
利用ΔΔCt 法,相对定量,将目的基因的表达与看家基因的表达对比,获得沉默效果。