柏礼生物-LncRNA系统研究解决方案
一、LncRNA背景简介
LncRNA (Long noncoding RNAs, LncRNAs) 长链非编码RNA， 起初被认为是基因组转录的“噪音”，是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能。然而，近年来的研究表明，LncRNA参与了X染色体沉默（图1A），基因组印记以及染色质修饰，转录激活（图1B），转录干扰，核内运输等多种重要的调控过程，LncRNA的这些调控作用也开始引起人们广泛的关注。哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是LncRNA（相应的蛋白编码RNA的比例是1%），虽然近年来关于LncRNA的研究进展迅猛，但是绝大部分LncRNA的功能仍不清楚，随着研究的推进，各类 LncRNA 的大量发现，LncRNA 的研究将是 RNA 基因组研究非常吸引人的一个方向，使人们逐渐认识到基因组存在人类知之甚少的“暗物质”。
图1A：LncRNA参与X染色体的沉默；B：LncRNA参与基因的转录激活
二、已知的几种LncRNA的作用机制
1) 在编码蛋白基因的上游启动子区转录，从而干扰邻近蛋白编码基因的表达（如酵母SER3基因）；
2) 可作为小分子RNA（如miRNA）的前体分子或者miRNA的反义YZ分子。
3) LncRNA结合作为结构组分与蛋白质形成核酸蛋白质复合体，调节相应蛋白的活性；
4) YZRNA 聚合酶Ⅱ，或介导染色质重构和组蛋白修饰，而影响基因表达；
5) LncRNA与编码蛋白基因的转录本形成互补双链，YZmRNA的翻译。
6）LncRNA与编码蛋白基因的转录本形成互补双链，干扰mRNA的剪切，进而产生不同的剪切形式；
7) LncRNA与编码蛋白基因的转录本形成互补双链，在Dicer酶作用下，降解mRNA或产生内源性的siRNA，调控基因的表达水平；
图2、LncRNA的8中作用方式
三、LncRNA研究策略
柏礼生物的LncRNA专家团队可以为您提供从LncRNA筛选、验证，LncRNA的功能探索以及更深层次的靶点寻找和表达调控机制探索等全方位的服务。
（1）、差异性的LncRNA的筛选
A、生物信息学预测
根据客户提供的转录组信息、基因特征，通过与数据库（agilent_ncRNA、LncRNAdb、Gencode V13、H-invDB、UCSC_lincRNAsTranscripts等）比较，去除已知可能蛋白编码转录本、tRNA、rRNA、repeat等预测可能的LncRNA
B、高通量的表达谱芯片
| 芯片名称 | 物种 | 格式 | 非冗余探针统计 |
| Biolily LncRNA 芯片 （柏礼高通量LncRNA芯片） | 人 | 4*180K | LncRNA 46506条 +mRNA 30656条 |
C、新一代的测序
具有现代的DNA测序技术的快速测序速度已经有助于达到测序完整的DNA序列。
通过逆转录法，将LncRNA逆转录成cDNA，确定某一段序列，再通过RACE方法，确定已知序列的两端的序列。
（2）、生物信息学分析
根据高通量芯片数据，经过大型服务器处理，进行以下几项专业的生物信息学分析：
如需要详细的LncRNA课题/实验指导，欢迎联系柏礼生物的技术工程师！
