STR细胞系鉴定
1、STR细胞系鉴定的重要性
选择正确的细胞,是实验成功的一半 细胞是一种很特殊的商品,由于其具有可复制性,因此很容易被一些商家自行复制后再出售,而这些自行传代复制的细胞几乎没有成本,所以很容易引起大家购买.但是这些细胞传代的次数、培养的条件以及是否有污染等都无法得到保障,甚至有老师买了这种细胞做了很多的实验都没有结果,很长时间之后才发现细胞被污染了. 为了让您解除后顾之忧,我们建议您在Z开始获得细胞系的时候、细胞传代一段时间之后以及即将发表论文的之前,都对您的细胞进行STR鉴定.以确保您使用细胞的正确性.使用正确的细胞,是您实验成功的一半.
在过去的 45 年里,细胞生物学方面的数据一直在发表,但是应用于生物医学研究领域的哺乳动物细胞被错误鉴定和交叉污染的问题,一直是一个普遍存在的突出问题。早在1970年代,一项研究就发现,被广泛使用的Hela细胞系就曾被污染,这一事件当时就促使细胞系质量控制手册的诞生。HeLa细胞株是由正常子宫颈细胞被一 人类乳突状瘤病毒(Human Papillomavirus 18或HPV18)转型成癌细胞的,而且和正常子宫颈细胞有许多不同。
从那时候开始,细胞身份鉴定成 一个受科学家关注的问题,也是从那时候开始越来越多的细胞被污染事件开始出现。人们已经开始意识到细胞被污染的问题,导致细胞交叉污染的原因和预防措施也已经被公布,然而问题却一直有增无减,研究人员继续发表从错误鉴定和交叉污染的细胞系所获取的数据。
据估计, 国外实验室已建株细胞有接近 20% 存在上述问题, 有 15-25% 的研究论文因为使用了被错误辨识和交叉污染的细胞而导致错误的结论。这造成大量研究经费的浪费,并产生了大量无效或错误数据。
2008年,Josephine Nefkens研究所的分子生物学家Winand Dinjens与同事发现食管腺癌细胞其实与食管扁平细胞癌细胞系具有相似的基因型。这些结果促使他们开始关注细胞身份问题。 Dinjens开始验证这些细胞系,将它们与原始的组织进行基因型比对,结果发现,这些细胞系与原始组织细胞已经有不同的基因型。
在13株食管腺癌细胞系中,其中3株:SEG-1,BIC-1和SK-GT-5被污染,这些细胞株混合有其他癌细胞。这些细胞系已经被多家实验室应用在两个临床试验、并发表了超过100篇SCI文章,并申请了11个美国专利,这一研究结果被发布在一期的Journal of the National Cancer Institute(JNCI)。
2007 年 NIH发布了通知,强烈建议在使用培养细胞的时候进行鉴定(authentication)。2008 年底,专家提议ATCC致力于人源细胞系的鉴定工作,并制定鉴定的标准程序。
二、
STR细胞系鉴定的方法选择:
近年来,大量研究表明
STR 基因分型方法是进行细胞交叉污染和性质鉴定的Z有效和准确的方法之一,STR基因分型应用于细胞鉴定已被ATCC等机构强烈推荐。美国的ATCC 细胞库、德国的DSMZ细胞库以及日本的JCRB细胞库等为STR 分型提供了各细胞株的数据供比对。
三、
STR细胞系鉴定标准的制定:
2011年初,美国菌种保藏ZX(ATCC)制定了人源细胞系
STR鉴定标准,旨在约束因细胞交叉污染和错误辨识所导致的无效科研数据的不断扩增。更重要的是,细胞系的精确鉴定在研发基于细胞下的医学产品时起到至关重要的作用,它能避免将人体细胞暴露于错误鉴定细胞中的风险。
四、 基于STR的
STR细胞系鉴定方法可以轻松、快速地鉴定细胞身份
STR细胞系鉴定细胞培养中可以使用许多方法对交叉污染进行鉴定,如同功酶分析、染色体组分型、人淋巴细胞抗原(HLA)分型和扩增片段长度多态性(AFLP)的特征分析。但是,比较好的方法是
STR图谱法,在ATCC,STR 分析使用的是多重 PCR,可以同时扩增 8 个 STR 位点加 1 个性别决定位点Amelogenin。每个被分析的人源细胞系都有其独特的 DNA 重复模式,因此通过与基础图谱进行比对, 即可对每一批新细胞系的身份进行确证。 STR 方法防止了 ATCC 将其 6 个“错误”细胞系进一步传播出去 — 因为经过 STR 分型后,发现 原本来自女性的细胞系中存在着 Y 染色体特异的扩增产物。
五、釜诚生物
STR细胞系鉴定技术流程
STR细胞系鉴定STR位点的选择
为了进一步提高鉴定的分辨率,我们除了包含ATCC检测的8个STR和1个性别决定位点Amelogenin外,另新增了11个高度多态性位点。
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