微生物多样性研究,目前科研技术上有很多,比如DGGE,TGGE,荧光原位杂交(FISH),aflp。sscp....各种方法各有优缺点
而目前主流的技术DGGE优点:
1.不需要培养,可以采用天然的样本
2.检测极限低1%左右的优势菌可以被检测到
3.检测速度快
4.结果准确可重复高
5.同时检测多种微生物
6与其他方法结合
DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis),即变性梯度凝胶电泳,是根据DNA在不同浓度的变性剂中解链行为的不同而导致电泳迁移率发生变化,从而将片段大小相同而碱基组成不同的DNA片段分开。具体而言,就是将特定的双链DNA片段在含有从低到高的线性变性剂梯度的聚丙烯酰胺凝胶中电泳,随着电泳的进行,DNA片段向高浓度变性剂方向迁移,当它到达其变性要求的浓度变性剂处,双链DNA形成部分解链状态,这就导致其迁移速率变慢,由于这种变性具有序列特异性,因此DGGE能将同样大小的DNA片段很理想地分开,它是一种很有用分子标记方法。现已广泛应用于生物多样性调查、亲缘关系鉴定、基因突变检测等多个领域。
美亿美生物提供代做DGGE技术服务
技术路线如下﹕
利用PCR-DGGE技术对土壤、海洋 环境污泥、水样、空气,动物肠道内容物、酒曲、窖泥等环境中的微生物菌系进行半定量和多样性分析。
实验包括:引物设计,基因组DNA电泳图, PCR电泳图, DGGE电泳图,聚类分析图,主成份分析图和多样性分析;DGGE胶图主要条带标注,DGGE胶中特异条带的回收,特异条带PCR扩增,特异条带克隆测序,序列比对分析,种属系统发育分析。
(2).我们为您提供的结果
提交结果包括:PCR结果的胶图、PCR产物的变性梯度凝胶电泳分析图、主要电泳条带的序列测定及其序列分析、测序峰图及序列,测序结果分析报告。
为您在研究中了解微生物的变化和对相关环境的影响
我们技术部提供实验的同时,进行深度数据分析,在您论文中,添砖加码,成功完成论文的投递。
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