提供商:
烈冰科技
服务名称:
转录组测序服务、转录组测序数据分析服务、转录组芯片数据分析服务
应用范围
- 构建自己的转录组数据库;
- 定量基因表达,找出关键基因;
- 研究基因表达的可变剪接;
- 结合其他组学数据,进行深入挖掘。
烈冰技术优势
- 自主研发了国际认可的差异可变剪接算法——ASD,验证率高达80%,业内领先;
- 烈冰科技根据实验设计提供ABI Ion Proton和illumina Hiseq4000两种高通量平台。并针对不同平台数据制定多套流程;
- 国内率先使用Ion Proton测序平台,测序速度快,4小时内即可完成测序实验;同数据量的情况下,Ion Proton较Illumina Hiseq能测定更多的转录本,提供更为准确的基因表达数据;Ion Proton具有先天性链特异性,能将overlapped gene从基因表达中和他们的正向的基因区别开;
- 精确到单核苷酸水平,可区分高度同源的RNA 分子,鉴定剪切变异体和RNA 多态性;
- 整合众多学界公认数据库,从本质上提高后期分析的广度和精度;
- 结合烈冰科技多年的生物信息分析体系和已发表高分文献分析思路,针对不同生物学问题提供定制化分析方案设计;
- 提供多组学联合分析;
实验流程
分析流程
结果展示
差异表达基因火山图
基因聚类分析图
信号通路互作网络
Denovo拼接共表达分析网络
发表文献
- Liu Z, et al. Autism-like behaviours and germline transmission in transgenic monkeys overexpressing MeCP2. Nature. 2016 Feb 4;530(7588):98-102.
- Cai Z, et al. Transcriptomic analysis of hepatic responses to testosterone deficiency in miniature pigs fed a high-cholesterol diet. BMC Genomics. 2015 Feb 6;16:59.
- Xu T, et al. SP1-induced upregulation of the long noncoding RNA TINCR regulates cell proliferation and apoptosis byaffecting KLF2 mRNA stability in gastric cancer. Oncogene. 2015 Nov 5;34(45):5648-61.
- Xu T, et al. SP1-induced upregulation of the long noncoding RNA TINCR regulates cell proliferation and apoptosis by affecting KLF2 mRNA stability in gastric cancer. Oncogene. 2015 Mar 2.
- Wang F, et al. Alternative splicing of the androgen receptor in polycystic ovary syndrome. Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 Apr 14;112(15):4743-8.
- Zhou X, et al. Transcriptome analysis of alternative splicing events regulated by SRSF10 reveals position-dependent splicing modulation. Nucleic Acids Res. 2014 Apr;42(6):4019-30.