特别提示:包括一步法microRNA反转录试剂盒在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床YL及其他非科研用途!
产品名称:一步法microRNA反转录试剂盒
英文名称:One Step microRNA cDNA Synthesis Kit
产品货号:MT0005
产品规格:25T|100T
由于miRNA(microRNA)分子序列较小,仅20nt左右,没有真核生物特有的Poly(A)尾巴结构,采用传统Oligo dT引物和随机引物很难获得从miRNA到cDNA的反转录产物。目前普遍采用的解决方案有两种:特异性反转录引物(下图A所示)、两步加A法反转录方案(下图B所示)。Biorab公司开发出一套全新的一步法miRNA反转录试剂盒,可以对成熟的miRNA同时完成Poly(A)反应和反转录反应,直接获得含有特异性tag和15(T)的cDNA产物(下图C所示)。该方法使得miRNA反转录与mRNA的反转录一样轻松,直接将提取的microRNA与反应缓冲液混合物混合并置于PCR仪上1小时即可获得高浓度的、包含所有miRNA分子的cDNA产物,获得的cDNA产物适合于采用SYBR Green染料法进行RealTime PCR进行定量检测。
产品组成: 组分 | MT000(25T) | MT0005B(100T) |
4×One step miRNA RT Solution | 125μl | 500μl |
10×miRNA RT Primer | 50μl | 200μl |
RNase Free H2O | 1ml | 1ml×2 |
储存:请置于-20℃,可保存2年,避免反复冻融。
注:如4×One step miRNA RT Solution出现沉淀属正常现象,可用手捂化,混合均匀后使用不影响实验结果。
特别说明: 10×miRNA RT Primer 引物为5"-CAGGTCCAGTTTTTTTTTTTTTTTVN-3",定量扩增用特异性上下游引物进行扩增,下图2是以 hsa-miR-21 为实例说明特异性上下游引物的设计方法(Biorab的microRNA 荧光定量 PCR 试剂盒提供所有 miRNA 检测,货号:MTAXXXXX,所有引物均经过设计优化,详细请于引物列表中查询。如果您研究的miRNA分子不在列表中,请来信咨询,我们将及时给您优化设计)。
图1:技术原理图:
图2:hsa-miR-21实例设计原理:
操作方法:1.按以下组分配制反转录反应液:
模板 | miRNA | 0.01-0.1μg |
Total RNA | 0.1-2μg |
4×One step miRNA RT Solution | 5μl |
10×miRNA RT Primer | 2μl |
Rnase-Free H2O | Up to 20μl |
2. 在PCR 仪上按以下条件进行反应:
37℃——————60min
95℃——————5分钟
3.获得 cDNA 产物后使用microRNA 荧光定量 PCR 试剂盒进行 miRNA 定量检测。使用该试剂盒反转录所得 cDNA 产物包含了样品中所有miRNA 反转录产物,可用于多个基因的检测分析,可使用内参基因进行定量矫正。内参基因可选择使用RNU6B miRNA 荧光定量 PCR 试剂盒(货号:MTA01501),适用于来源于人和鼠等哺乳动物的样品;RNU44 miRNA 荧光定量 PCR 试剂盒(货号:MTA01502)、 RNU48 miRNA 荧光定量 PCR 试剂盒(货号:MTA01503),适用于来源于人的样品;SnoRNA135 miRNA 荧光定量 PCR 试剂盒(货号:MTA01504) 、SnoRNA202 miRNA 荧光定量 PCR 试剂盒(货号:MTA01505)适用于来源于鼠的样品。Biorab 提供的内参扩增引物浓度均为 10μM,每 20μl 反应体系中加入0.4-0.8μl。
根据机型选择步骤A或B,配制反应体系:
步骤A: 需要添加 ROX 染料进行反应孔间信号矫正的Real-Time PCR 仪,包括:ABI PRISM7000/7700/7900HT,7300/7500/7500 Fast Real-Time PCR(Applied Biosystems);Mx3000P(Stratagene)等。按照如下组分配制 20μl PCR 反应体系:
加入物 | 加入量 | 终浓度 |
5×Top HS SYBR Green qPCR Mix | 4μl | 1× |
50×ROX Reference Dye | 0.4μl | 1× |
PCR Forward Primer(10μM) | 0.4-0.8μl | |
PCR Reverse Primer(10μM) | 0.4-0.8μl | |
cDNA 模板 | 1~2.5μl | |
ddH2O | Up to 20μl | |
注:引物初次使用请用0.4μl,视实验结果进行调整。
步骤B:无需添加 ROX 染料进行反应孔间信号矫正的Real-Time PCR 仪,包括:LightCycler(Roche Diagnostics);MiniOpticon、Opticon2、MyiQ 2、CFX96 Real-Time PCR(Bio-Rad & MJ);Line-Gene(Bioer,杭州博日)等。按照如下组分配制 20μl PCR 反应体系:
加入物 | 加入量 | 终浓度 |
5×Top HS SYBR Green qPCR Mix | 4μl | 1× |
PCR Forward Primer(10μM) | 0.4-0.8μl | |
PCR Reverse Primer(10μM) | 0.4-0.8μl | |
cDNA 模板 | 1~2.5μl | |
ddH2O | Up to 20μl | |
4.进行 Real-Time PCR 反应,通常采用两步法,程序如下:
步骤 | 加入量 | 终浓度 | 循环数 |
Stage 1: | 95℃ | 15分钟 | |
Stage 2: | 95℃ | 5s | |
| 60℃ | 30s | 30cycles |
Stage 3: | Dissociation analysis |
注意:使用该方法通常可以准确检测到>0.01fM的microRNA 分子,过多的循环数会造成精确性降低。推荐的循环数为 30 个,在检测极低样品浓度时可将循环数调整到35 个。
5.扩增结果分析和数据处理:
反应结束后确认 Real-Time PCR的cDNA 样品和 NTC 阴性对照的扩增曲线和融解曲线。
除了一步法microRNA反转录试剂盒,,我公司还供应以下相关产品:
名称:AP/liver/kidney/bone mRNA原位杂交试剂盒
货号:ZN0072
规格:100T
基本信息:
保存条件:4℃保存一年
工作量:100张切片。
有效期:一年。
适用种属:human,rat,rabbit,mouse
标记方式:3’—尾段标记
试剂盒中内容:
1.胃蛋白酶(×10; Pepsin)2ml;
2.预杂交液 2ml;
3.AP/liver/kidney/bone mRNA原位杂交试剂盒寡核苷酸探针杂交液 2ml;
4.封闭液 5ml;
5.生物素化鼠抗*高辛 5ml;
6.SABC-POD 5ml;
7.生物素化过氧化物酶 5ml。
用户自备试剂:
原位杂交专用盖玻片;POLY-L-LYSINE;DEPC;20%甘油
缓冲液(3%柠檬酸,2×SSC,0.5×SSC,0.2×SSC,原位杂交用 PBS)
一.培养细胞和冰冻切片
准备工作:
固定液:4%多聚jiǎ醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6);1%多聚jiǎ醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6)
3%柠檬酸——100ml蒸馏水中加柠檬酸(C6H8O7•H2O)3g,PH2.0左右。
2×SSC——1000ml蒸馏水中加氯化钠17.6g,柠檬酸三钠(C6H5O7Na3•2H2O,分子量294)8.8g。
0.5×SSC——300ml蒸馏水加100ml 2×SSC即可。
0.2×SSC——270ml蒸馏水加30ml 2×SSC即可。
20%甘油——20ml甘油加80ml蒸馏水即可。
原位杂交用PBS(1000ml蒸馏水加氯化钠30g,Na2HPO4•12H2O 6g,NaH2PO4•2H2O 0.4g),PH7.2-7.6。
操作程序:
注意:zuì重要的是及时固定,并在固定液中加入0.1%的DEPC处理,以YZRNA酶对mRNA的分解作用。此外,过度固定对原位杂交有明显的不利影响。
1.玻片的处理:一般采用多聚赖氨酸或APES。切片厚度10-20μm。
2.细胞在多聚赖氨酸处理的盖玻片上进行培养,条件为37℃和5%的CO2,所用培养基为Dulbecco基础培养基。细胞长好后0.1M PBS(PH7.4)洗2分钟×3次。
3.培养细胞和冰冻切片均可用下述方法固定:固定液为4%多聚jiǎ醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室温固定 20--30分钟。蒸馏水充分洗涤,干燥后-20℃冰冻可保存2周以上。
4.30%H2O2 1份+纯甲*50份混合,室温处理30分钟。蒸馏水洗涤3次。
5.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%柠檬酸新鲜稀释的胃蛋白酶(1ml 3% 柠檬酸加2滴浓缩型胃蛋白酶,混匀),37℃或室温消化5—120秒钟。有时也可以不消化。原位杂交用 PBS洗3次×5分钟。蒸馏水洗1次。
6.后固定:胃蛋白酶消化后才需要。固定液为1%多聚jiǎ醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室温固定 10分钟。蒸馏水洗涤3次。
7.预杂交:湿盒的准备——干的杂交盒底部加20%甘油20ml以保持湿度。按每张切片20μι加预杂交液。恒温箱38-42℃2—4小时。吸取多余液体,不洗。
8.杂交——按每张切片20μι杂交液,加在切片上。将原位杂交专用盖玻片的保护膜揭开后,盖在切片上。恒温箱38-42℃杂交过夜(根据杂交情况可以调节)。
9.杂交后洗涤:揭掉盖玻片,37℃左右水温的2×SSC洗涤5分钟×2次;37℃0.5×SSC洗涤15分钟×1次; 37℃0.2×SSC洗涤15分钟×1次(如果有非特异性染色,重复0.2×SSC洗涤15分钟×1-2次)。
10.滴加封闭液:37℃30分钟。甩去多余液体,不洗
11.滴加生物素化鼠抗*高辛:37℃ 60分钟或室温120分钟。原位杂交用PBS洗5分钟×4次。勿用其它缓冲液和蒸馏水洗涤。
12.滴加SABC:37℃20分钟或室温30分钟。原位杂交用PBS洗5分钟×3次。勿用其它缓冲液和蒸馏水洗涤。
13.滴加生物素化过氧化物酶:37℃20分钟或室温30分钟。原位杂交用PBS洗5分钟×4次。
14.DAB显色:使用DAB显色试剂盒—1ml蒸馏水加显色剂A,B,C各一滴,混匀,加至标本上。一般显色20-30分钟。若无背景出现则可继续显色。也可自配DAB显色剂后显色。充分水洗。
15.必要时苏木素复染,充分水洗。
16.酒精脱水,二甲*透明,封片。
二.石蜡切片
如果有条件的话,应尽可能地采用新鲜标本。标本离体后,及时予以固定。固定液为4%多聚jiǎ醛/0.1 M PBS(PH7.0-7.6),含有1/1000 DEPC。标本较大时用刀片切成厚度不超过4mm的小块,固定1小时即可,较大的标本固定不要超过2小时。某些组织对过度固定尤其敏感,如动物大脑,固定时间30-40分钟,一般不要超过1小时。
1.常规脱水、浸蜡、包埋。切片厚度6-8μm。
2.玻片的处理:一般采用多聚赖氨酸或APES。
3.石蜡切片经常规脱蜡至水。30%H2O2 1份+蒸馏水10份混合,室温5-10分钟以灭活内源性酶。蒸馏水洗3次。
4.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%柠檬酸新鲜稀释的胃蛋白酶(1ml 3% 柠檬酸加2滴浓缩型胃蛋白酶,混匀),37℃或室温消化3--30分钟(视标本新旧、厚薄自行调整)。用户可以比较不同的消化时间,例如5分钟,10分钟,20分钟,30分钟。以找到zuì佳的消化时间。原位杂交用PBS洗3次×5分钟。蒸馏水洗1次。其余步骤和冰冻切片6-16步相同。
结果观察:
AP/liver/kidney/bone的细胞胞浆着色呈棕黄色。
注意事项:
由于特定的mRNA序列仅占总mRNA的极少数,加上基因仅由四个碱基排列组合而成,因此原位杂交容易出现非特异性染色。通过不加探针和用阴性标本做对照,基本可以确定染色是否为特异性的。有明显的非特异性染色现象时,用预杂交液对含探针的杂交液进行稀释,一般稀释2—10倍;并应加强探针杂交后的洗涤。如果有少量的细胞核着色属于正常情况;如果出现大量的细胞核着色,往往和标本固定时间过长有关,应重新处理标本。
温馨提示:不可用于临床ZL。