10x Genomics Chromium 3'单细胞转录组测序_详细资料

产品信息

晶能生物，12台10x Genomics仪器，服务全国！
单细胞水平的高通量基因表达谱分析
对复杂细胞群体深入分析，表征单个细胞的表达谱。
可同时检测CRISPR干扰、细胞表面蛋白，
避免单个细胞的异质性生物学信息被大量细胞的均质化掩盖。

>技术原理 Single Cell 3'

GEM在一个八通道的微流体芯片中产生，大约可形成10万个。每个凝胶珠带有大约750,000个设计好的序列。
每条序列分别包含：
(i) Illumina P7 and R2 sequence (read 2 sequencing primer)
(ii) 16bp 10x Barcode
(iii) 10bp randomer to index molecules (unique molecular identifier, UMI)
(iv) poly-dT primer sequence

GEM形成后，细胞裂解，凝胶珠自动溶解释放大量barcode序列，随后mRNA逆转录为cDNA。
油滴破碎，cDNA为模板进行PCR扩增，然后进行cDNA打断、加测序接头P5及测序引物R1等传统二代测序的建库过程。

（图片来源：10x Genomics ChromiumSingleCell3’SolutionApplication）

>技术优势
(i) 一次测序可同时上8个样本，每个样本可捕获几千个细胞；
(ii) 相对于其他平台，单细胞测序的成本较低；
(iii) 适合研究复杂的细胞群体；
(iv) 无需分选细胞，就可以实现单细胞测序

>样本要求
细胞状态
单细胞悬浮液（细胞悬浮液由客户自己制备），悬浮液中细胞不能成团，少碎片，存活率>90%，细胞直径<30µm；不能存在逆转录YZ剂及非细胞的核酸分子。
细胞数量
总量>2×10⁵个，同一个细胞平行准备2份（1份质检，1份实验）
细胞运输
细胞在冻存液中，利用干冰保护运输，请先预估运输时间，确保运输过程中有足够的干冰（有条件的客户用液氮运输为ZJ）。

>生物信息学分析

>应用方向

> 延伸应用
Single Cell Gene Expression 和 Cell Surface Proteins技术联合
联合优势
>>>测量细胞表面蛋白标记物、剪接亚型和翻译后修饰，以识别细胞类型和状态，并检测罕见的细胞类型
>>>检测RNA水平难以测量的标记物
>>>评估mRNA和蛋白表达谱的差异
>>>与单独的转录组测量相比，获得更详细的细胞表型特征

应用方向
癌症
>>>研究癌症的发病途径和其他复杂的生物系统
>>>识别不同类型癌症的生物标志物
>>>基于蛋白质和/或转录本的癌症药物开发
>>>更全面的肿瘤微环境分析

免疫学
>>>研究受体、细胞、应答细胞数量水平上的机制
>>>研究淋巴细胞与靶细胞之间的动态相互作用
>>>T细胞基因工程和基于TCR的融合蛋白筛选
>>>开发有效的接种疫苗 (抗体筛选)

神经科学与传染病
>>>发现罕见的细胞类型和新的生物标记
>>>更完整的通路和细胞信号分析

人体细胞图谱/组织编目
>>>增强组织和器官的表型
>>>构建更完整的框架以更好地了解疾病状态

>我们的优势
(i) 多家ZD合作单位；
(ii) 处理过多种细胞，有丰富的建库经验-人、小鼠或其他物种的培养细胞或组织细胞，包括PBMC、神经细胞、肿瘤细胞、细胞、胚胎细胞、免疫细胞、干细胞等等；
(iii) 提供个性化服务-带仪器上门服务，完成10x单细胞建库；根据您的需求进行个性化分析。
(持续更新中)

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