微卫星（STR/SSR）分型检测服务

STR介绍
        STR（短串联重复序列），又称为微卫星标记或SSR。一般有2-6bp的核心序列串联重复而成，构成了STR基因座的遗传多态性。
        STR/SSR具有分布广泛均匀、多态性丰富、遵循孟德尔共显性遗传、信息量大、检测简便等优点，STR/SSR分型GX快捷，结果准确，是非常重要的遗传标记，在遗传制图、连锁性分析、亲子鉴定、疾病基因定位和物种多态性研究等领域有着广泛的应用。
上海翼和生物微卫星分型服务：
        根据具体实验规模，提供两种检测平台，分别为：适合中低通量检测的多重荧光PCR STR/SSR分型服务和适合高通量的基于二代测序的Hi-STR分型服务。
多重荧光PCR的微卫星（STR/SSR）分型服务
        上海翼和生物采用通用荧光引物方案，多重PCR扩增STR/SSR位点，利用ABI遗传分析仪对荧光标记DNA片段进行检测，利用分子量内标进行DNA片段长度计算，使得微卫星分型变得GX，快捷，结果更加精确可靠。
技术路线： 
翼和特色
 

翼和特色	内容
多重荧光 STR分型	十余年STR分型经验，日产5000个STR分型数据
	可进行多位点多重反应，经济，GX
	实验灵活，检出率高，实验周期短
	分型过程加入荧光标记分子量内标，分型结果准确
	严格实验流程质控以及10%重复对照设置，保证实验结果重复性
	检出率>95%
	准确率>98%

 
 
服务流程
A.微卫星（STR/SSR）分型引物筛选
   1)客户提供样本以及位点信息；
   2)翼和设计相关位点的扩增引物，并合成；
   3)预实验抽样小试，摸索并优化反应条件（包括退火温度，镁离子浓度等）；
   4)3730 XL测序仪电泳
   5)Genemapper分析，数据导出；
B.大规模分型实验
   1)大规模样本位点扩增；
   2)3730 XL测序仪电泳；
   3)Genemapper分析，数据导出；
   4)交付实验报告，包括实验材料，方法，引物序列等；

Hi-STR分型服务
        Hi-STR结合多重PCR技术和高通量测序技术，对需要检测的位点设计特异性引物，在单管内进行多重PCR扩增，不同的样本以不同的Barcode引物区分。混合样本后，在Ion Proton/illumina 主流测序平台上，对扩增子进行高通量测序。测序结果使用生物信息学方法，实现对STR位点的检测，与传统的凝胶电泳或毛细管电泳相比，可以直接根据序列，准确判断STR位点的重复次数。Hi-STR适用于核心重复区域3bp及以上的微卫星位点，配合各类高通量测序仪，使得STR分型具有更准确、更灵敏的特点，二代高通量测序，可将上千样本和STR位点混合检测，使检测更加GX经济。
 技术路线： 
翼和特色

翼和特色	内容
HI-STR分型	翼和自主知识产权超高重PCR捕获技术，技术先进，结果可靠
	通量高，STR位点30-500个之间，数百数千样本推荐使用
	均一性高，95%扩增子测序深度在平均测序深度0.2X以上
	低样本浓度，DNA浓度>40ng/ul
	检出率>95%
	准确率>98%，可与荧光引物PCR分型方法相验证

 
         本方法适用于动物植物及人类的遗传图谱绘制、QTL定位、生物多样性、动植物SSR位点检测、群体遗传结构等诸多领域。

上海翼和应用生物技术有限公司
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