简化基因组测序(RAD-seq) RAD- seq (Restriction-site associated DNA-sequnencing),即基于酶切的简化基因组测序技术,是指利用限制 性内切酶对基因组进行酶切,结合一定大小的插入片段文库,对其进行高通量测序,快速鉴定高准确性的变异标记(SNPs)信息用于群体进化、多态性图谱、遗 传图谱构建(QTL 定位)、性状关联和辅助scaffold 组装到染色体等分析,广泛应用于系统进化、分子育种、种质资源鉴定等领域。与传统技术相 比,RAD-Seq技术操作简单、不受参考基因组限制、可简化复杂基因组;另外,基于SNPs 的分子标记技术性价比高,稳定性好,在基因组中分布更加广 泛,特别是适合大样本量的分析。
根据统计,2013年度发表的基于RAD-Seq研究论文是45篇,比2012年度发表的多出135%,并且比前两年度增长了400%。 而且RAD技术应用范围是跨物种的,包括动物(69%),植物(22%),昆虫(7%)以及真菌(2%)。说明RAD-Seq技术正逐步被科学家所采纳于 各个领域的基础研究中。
研究应用 我们的优势 拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台,实验周期短,质量可靠。
拥有Illumina HiSeq 2500、MiSeq等多种高通量测序平台。
技术人员经验丰富,可以根据合作伙伴要求提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果。
拥有专业的生物信息团队和超算服务器,可为合作伙伴提供全面生物信息分析服务与技术支持。
技术服务流程
实验流程
1 对基因组进行酶切后,连接P1接头(含有barcode);
2. 随机打断;
3. 连接P2接头;
4. 通过PCR筛选同时带有P1和P2接头的序列;片段大小选择;
5. 上机测序
RAD项目样品要求
样品浓度、纯度及总量的建库要求
注:以上表格中浓度定量是以Qubit定量为准。DNA样品需无污染,无明显降解
更多详情:http://www.biogenius.cn/htm/products/genomics/radseq/