全基因组表达谱芯片全面解决方案_详细资料

产品信息

提供商： BIOTREE 服务名称：全基因组表达谱芯片全面解决方案规格：单次对比

基因组学，是研究生物基因组和如何利用基因的一门学问。该学科提供基因组信息以及相关数据系统利用，试图解决生物、医学、工业领域、食品与农业等领域的重大问题。
全基因组表达谱是指全基因组的转录水平。通过全基因组表达谱研究，加以生物信息学分析，能够解析出在特定条件下（疾病、药物刺激等）整个基因组哪些基因的表达水平上调或下调。生命体是一个复杂的系统，生命活动的调控往往不是单一基因完成的，需要站在宏观（全基因组）层面上研究基因互作。
全基因组表达谱芯片能够快速、高通量、特异性地完成全基因组表达谱研究，是全基因组表达谱研究的技术手段。
一、技术路线和方法：

二、生物信息学分析
2.1 基本数据分析
Part01：原始数据预处理与均一化
Part02：差异基因筛选
Part03：聚类分析（层次聚类、K-means聚类）
Part04：差异基因GO分类
Part05：差异基因pathway分析
Part06：基因互作网络构建（Network）
2.2 高级数据分析
Part08：转录因子结合位点分析（对植物）
Part09：数据驱动网络构建（对多个时间点）
Part10：疾病分型
Part11：疾病预测模型构建
Part12：基因表达趋势显著性分析

三、芯片平台

芯片平台
（Human）型号转录本数量规格货号

Affymetrix Human Genome U133
Plus 2.0 Array 47000条(包含38500个基因) 1× BT1000111

Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K 27958条mRNA 8×60K BT1000112

7419条lincRNA

Agilent Agilent Whole Human Genome Oligo Microarray 41,000条 4×44K BT1000113

华联人类表达谱芯片v6 32679条(包含938条控制探针) 1× BT1000114

芯片平台
（RAT）型号转录本数量规格货号

Affymetrix Rat Genome 230 2.0 Array 31000条(包含28000个基因) 1× BT1000131

Agilent Agilent SurePrint G3 Rat Gene Expression 8x60K 30003条 8×60K BT1000132

Agilent Agilent Whole Rat Genome Oligo Microarray 41012条 4×44K BT1000133

华联大鼠表达谱芯片v1 25338条(包含980条控制探针) 1× BT1000134

芯片平台
（Mouse）型号转录本数量规格货号

Affymetrix Mouse Genome 430 2.0 Array 39000条(包含34000个基因) 1× BT1000121

Agilent SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8x60K 39430条mRNA 8×60K BT1000122

16251条lincRNA

Agilent Agilent Whole Mouse Genome Oligo Microarray 41174条 4×44K BT1000123

华联小鼠表达谱芯片v2 27295条(包含872条控制探针) 1× BT1000124

注：其他种类芯片请联系公司销售工程师
四、完成时间
2个月，（其中生物信息分析1个月）
所有版权及解释权归BIOTREE公司所有！

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芯片平台（Human）	型号	转录本数量	规格	货号
Affymetrix	Human Genome U133 Plus 2.0 Array	47000条(包含38500个基因)	1×	BT1000111
Agilent	SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K	27958条mRNA	8×60K	BT1000112
Agilent	SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K	7419条lincRNA	8×60K	BT1000112
Agilent	Agilent Whole Human Genome Oligo Microarray	41,000条	4×44K	BT1000113
华联	人类表达谱芯片v6	32679条(包含938条控制探针)	1×	BT1000114

芯片平台（RAT）	型号	转录本数量	规格	货号
Affymetrix	Rat Genome 230 2.0 Array	31000条(包含28000个基因)	1×	BT1000131
Agilent	Agilent SurePrint G3 Rat Gene Expression 8x60K	30003条	8×60K	BT1000132
Agilent	Agilent Whole Rat Genome Oligo Microarray	41012条	4×44K	BT1000133
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芯片平台（Mouse）	型号	转录本数量	规格	货号
Affymetrix	Mouse Genome 430 2.0 Array	39000条(包含34000个基因)	1×	BT1000121
Agilent	SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8x60K	39430条mRNA	8×60K	BT1000122
Agilent	SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8x60K	16251条lincRNA	8×60K	BT1000122
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