提供商:
上海厚基生物科技有限公司
服务名称:
Label free实验技术服务
规格:
个
1、Label free技术概述
蛋白质非标记定量技术(label free),通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签,只需分析大规模鉴定蛋白时产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。
目前主流方法为:以MS1为基础,计算每个肽段的信号强度在LC-MS色谱上的积分,Maxquant是linxian的蛋白质组学定性定量算法,现在已经渐渐成为蛋白质组学领域内的标准解决方案之一。
2、Label free技术优势
蛋白质不需要进行标记,所以需要的样品总量少,可对极微量蛋白样品进行定量差异分析。服务流程,质量控制及周期
整个实验分为预实验和正式实验部分,总实验周期为5周。
预实验部分包括:蛋白样品制备,蛋白定量,SDS-PAGE胶,蛋白酶解,质谱预实验,出具预实验报告。以确保蛋白和肽段样品符合正式实验的要求。
正式实验部分包括:正式实验质谱分析,数据库检索及出具正式实验报告。
3、报告内容
word版实验报告:包括实验原理,实验流程,实验试剂仪器,实验步骤及参数,实验结果
excel版定性定量差异数据:全部检测蛋白的登录号及名称,分子量、等电点、肽段数等常规数据,蛋白定量数据及相应的P值。
生物信息学分析数据:统计学差异表达蛋白的GO,pathway,network分析报告
RAW文件:质谱原始数据文件 4、样品要求
样品类型 | 样品要求(/组样品) |
蛋白质提取物 | 浓度>1ug/ul,蛋白质总量>100ug |
细胞样品 | 细胞量>106 |
组织样品 | 动物,微生物组织湿重>5mg;植物新鲜组织>50mg |
体液样品 | 血液体积>200ul |