三维基因组/Hi-C技术服务_详细资料

产品信息

Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。
（引自Pueschel R, Coraggio F, et al. From single genes to entire genomes: the search for a function of nuclear organization. Development , 2016 , 143 (6) :910）
武汉金开瑞生物工程有限公司技术顾问、华中农业大学教授，曹罡课题组与华中农业大学李国亮教授课题组在国际著名期刊Nature Genetic（IF=27.125）上联合发表题为“Digestion-ligation-only Hi-C is an efficient and cost-effective method for chromosome conformation capture”的研究论文。该论文主要介绍了一种新的染色体构象捕获技术（DLO Hi-C），此技术信噪比高，质量控制于早期，为解析基因组三维结构提供了一种新型、GX、经济的研究方法。
DLO Hi-C实验流程图
交联——酶切——环化连接——酶切——建库——测序分析

特点：在测序量更少情况下，染色质结构分析数据更多，简化文库构建过程，提升建库成功率。
研究思路
Hi-C可以与RNA-Seq、ChIP-Seq、ATAC-Seq等数据进行联合分析，从基因调控网络和表观遗传网络来阐述生物体性状形成的相关机制。
结果展示
1、几种不同的Hi-C衍生方法的对比分析

2、几种不同的Hi-C的衍生方法的矩阵图

3、较优的三种Hi-C衍生技术的A/B compartments 、TADs、Loops 的数据读取。

（引自Lin D, Hong P, et al. Digestion-ligation-only Hi-C is an efficient and cost-effective method for chromosome conformation capture. Nature Genetics, 2018 , 50 (5)）
推荐文献

题目

期刊

影响因子

实验方法

关键词

The Energetics and Physiological Impact of Cohesin Extrusion

Cell

31.398

Hi-C+ChIA-PET+RNA-seq+ChIP-seq+Western blot+CRISPR/Cas9

浆细胞瘤、染色体易位、CTCF、TAD、ATP、B细胞

Genetic determinants of co-accessible chromatin regions in activated T cells across humans

Nature Genetics

27.125

Hi-C+RNA-seq +ATAC-seq

T细胞、CD4⁺T细胞、免疫性疾病、 eQTL

Diffuse gliomas classified by 1p/19q co-deletion, TERT promoter and IDH mutation status are associated with specific genetic risk loci

Acta Neuropathol

15.872

Hi-C+ GWAS

TERT启动子、弥漫性神经胶质瘤、TCGA

Promoter interactome of human embryonic stem cell-derived cardiomyocytes connects GWAS regions to cardiac gene networks

Nature        Communications

12.353

Hi-C+ GWAS+Western blot+CRISPR/Cas9

干细胞、心肌细胞、心脏基因网络

Integration of human adipocyte chromosomal      interactions with adipose gene expression prioritizes obesity-related genes from GWAS

Nature        Communications

12.353

Hi-C+GWAS+eQTL

脂肪细胞、染色质、肥胖基因、PPARG和CEBPB

金开瑞-功能蛋白质组学一站式服务商:
武汉金开瑞生物工程有限公司位于武汉国家生物产业基地，是一家专业致力于为制药企业、诊断试剂企业、科研试剂研发企业、高校和科研院所以及大型医院提供蛋白及相关研究技术服务的高新技术企业。六大核心技术平台、专业技术团队，ZD程度保证您的项目按时保质的实施。
蛋白质组分析平台——iTRAQ、SWATH、SILAC、Label-free、修饰蛋白质组，涵盖各种特殊样本（线粒体、膜蛋白、石蜡包埋等）；
检测分析平台——免疫学、细胞系、分子生物学检测、双荧光素酶报告基因；
基因服务平台——引物合成、基因合成、DNA提取、载体构建、定点突变；
病毒包装平台——慢病毒、腺病毒、腺相关病毒包装、稳转细胞株构建；
蛋白表达平台——提供从基因合成到蛋白表达的一站式服务；
抗体定制平台——单/多克隆抗体、人源化抗体、基因工程抗体、双特异性抗体、修饰抗体、诊断抗体、小分子抗体、抗体对、噬菌体服务。
更多服务内容及优惠活动，详见公司主页：http://www.genecreate.cn/
咨询电话：027-62431110
E-mail：marketing@genecreate.com
QQ：3013422302
更多详情请关注金开瑞微信！

您可能感兴趣的产品

题目	期刊	影响因子	实验方法	关键词
The Energetics and Physiological Impact of Cohesin Extrusion	Cell	31.398	Hi-C+ChIA-PET+RNA-seq+ChIP-seq+Western blot+CRISPR/Cas9	浆细胞瘤、染色体易位、CTCF、TAD、ATP、B细胞
Genetic determinants of co-accessible chromatin regions in activated T cells across humans	Nature Genetics	27.125	Hi-C+RNA-seq +ATAC-seq	T细胞、CD4⁺T细胞、免疫性疾病、 eQTL
Diffuse gliomas classified by 1p/19q co-deletion, TERT promoter and IDH mutation status are associated with specific genetic risk loci	Acta Neuropathol	15.872	Hi-C+ GWAS	TERT启动子、弥漫性神经胶质瘤、TCGA
Promoter interactome of human embryonic stem cell-derived cardiomyocytes connects GWAS regions to cardiac gene networks	Nature Communications	12.353	Hi-C+ GWAS+Western blot+CRISPR/Cas9	干细胞、心肌细胞、心脏基因网络
Integration of human adipocyte chromosomal interactions with adipose gene expression prioritizes obesity-related genes from GWAS	Nature Communications	12.353	Hi-C+GWAS+eQTL	脂肪细胞、染色质、肥胖基因、PPARG和CEBPB