上海翼和为回馈广大新老客户,特推出开学季优惠活动!在11月30日前捕获单价1元/碱基(bp)!还在等什么,快快拨打我们的服务热线吧!活动规则:技术服务:目标区间重测序(Hi-Reseq)
捕获折扣:1元/碱基
活动时间:2018年9月21日-2018年11月30日(日期以合同签订时间为准)参与方式:详情请拨打上海翼和服务热线021-33559491和021-33559492,我们会安排同事与您及时沟通。本次活动ZZ解释权归上海翼和应用生物技术有限公司所有。目标区间重测序背景介绍 在后基因时代,对基因组候选区段或候选基因的重测序的需求日益增加,候选区段范围在5K-100K之间,采用传统的Sanger测序或目标区域探针杂交捕获测序价格昂贵。因此基于超高重PCR的扩增子捕获测序应对该长度范围内的适用性强,针对连续或不连续区段,外显子靶标以及客户指定区间,设计特异性引物,经过引物优化及修饰,多重PCR一次性捕获所有目标区间。
上海翼和生物目标区段重测序服务采用翼和自主研发的多重PCR技术,克服扩增效率不均一问题,保证每个扩增子间拷贝数差异控制在平均深度的5-10倍(利用ABI7900定量PCR检测多重PCR产物,根据CT值判读产物浓度,确保产物间的均一性),90%扩增子reads数大于15,不浪费测序通量,也可根据客户需求,加大测序深度。
应用领域:孟德尔遗传性疾病的筛查和诊断,GWAS候选区段重测序,QTL定位区段重测序,候选基因自然变异分析和JZYL研究与应用等。
上海翼和生物重测序服务原理
实验原理1、设计多重PCR引物,从基因组DNA中扩增目标区域序列
2、优化多重PCR反应,使目标区域能够均匀覆盖
3、扩增目标区域,加测序接头,不同样本加上不同index区分
4、利用高通量测序平台对目标区域进行深度测序
5、生物信息学分析,找出目标区域中的多态或突变位点
上海翼和生物重测序服务流程 上海翼和生物技术优势 优势 | 指标 | 优势 | 指标 |
检测区间 | 5-100Kb | 测序深度 | 平均深度100×,可根据客户需求增加测序深度 |
反应重数 | 20-300重 | 重复性 | ~100% |
样本数 | 50-1000份 | 特异性 | 95%区段 |
扩增子长度 | 200bp | 质控标准 | Q30>90% |
样本要求1、若样品为基因组DNA,要求:DNA浓度≥20ng/ul,体积>20ul。纯度OD 260/OD280 在1.8~2.0之间。
2、若分型样品为血样,样本要求:血液样品,体积大于500ul,需用抗凝剂抗凝,送样过程中请注意保持低温,防止DNA降解。提取DNA将收取DNA提取费。
3、客户在寄送样品的时候,应在送样包裹中放置足量的冰袋,以减少在运输过程中因温度变化导致DNA降解的可能。
4、提供片段序列信息,被选区域可以是连续的基因组序列,也可以是独立片段或外显子序列。
结果提供1、实验报告,含实验材料与方法,所用引物序列等等
2、结果汇总和基本分析,各样本中存在的多态性位点或者罕见突变,测序深度以及蛋白注释等。
3、高级分析,公司可根据客户需求对数据进行分析,需客户提供参考文献依据。
总公司地址:上海市松江区王家厍路885弄7号云堡互联图书馆205实验基地:无锡市滨湖区梅梁西路138号生物医药产业园二期七号楼一楼
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