实验技术简介:小 RNA序列高度保守,可以调控基因的表,长度在18-30nt,主要包括miRNA、snRNA、snoRNA等。小RNA测序技术采用胶分离技术,收集 样品中15-35nt的RNA片段,利用高通量测序技术,一次性获得单碱基分辨率的数百万条小RNA序列信息,依托强大的生物信息分析平台,鉴定已知小 RNA,从而解析miRNA、snRNA、snoRNA和其它非编码RNA以及相应靶序列。
实验操作流程:
1、Total RNA抽取质粒
2、回收目的片段纯化
3、连接5' 和3' RNA接头
4、反转cDNA
5、PCR扩增
6、上机测序
7、生物信息分析
实验注意事项:
客户提供:
1、RNA:去蛋白并进行DNase 处理后的完整总RNA
2、组织:液氮处理,植物 ≥20ug ;动物 ≥10ug ;也可液氮研磨成粉末后加入Trizol (50-100mg 加入1ml Trizol );
3、全血样品:需新鲜样品时加入3 倍体积Trizol LS ,以防止RNA 降解。
4、浓度≥200ng/ul,纯度OD 260/280 =1.8~2.2 ;RIN ≥8
交付标准:
1、可结合客户的材料与需求,协商确定定制化信息分析内容。
2、数据产出统计:对测序结果进行图像识别(Basecalling),去除污染及接头序列;
统计结果包括:测定的序列(Reads)长度、Reads数量、数据产量。其他:
1、全物种覆盖:可对任意物种的miRNA进行检测
2、同时检测已知的和新miRNA :不仅可以检测miRBase中已知的miRNA,还可以发现新的miRNA
3、实时更新的miRNA数据库信息:可随时利用ZX的miRBase数据库对数据进行再分析,数据有效
4、灵敏度高:可检测在单个细胞中仅一个拷贝的低丰度miRNA
5、精确度高:可准确区分单碱基差异的miRNATel:010-57425721/57425722 Fax:010-80780672
E-mail:lab-manager@jiamay.com
Web:www.jiamay.com.cn www.jiamay.com
400免费热线:400-0007-401
Add:北京市朝阳区北苑路旭辉·奥都7#楼2404室 P.C.:100012
(未经允许,禁止转载)
资料下载:
嘉美实验外包服务项目总览.pdf
附件下载 (下载 1 次)
请 [登录] 后再下载!