GRSAM-03:拷贝数变异 本项分析依据深度测序或低覆盖度测序模式,分别可采用不同分析技术准确识别基因组拷贝数变异-CNV。精细度取决于测序深度。测序深度(coverage)与测序数据量直接相关,并与CNV的探测解析度(windows size)有一定的相关性。另外,通过CNV分析进一步可分析得到杂合性缺失(LOH),用于判断遗传结构变异和变异等位基因在样本中的比例。全基因组CNV分析对于外周血DNA或游离核酸ctDNA,肿瘤组织等样本适用。对于外显子组测序也可进行CNV项目的分析。
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全基因组重测序全基因组重测序是Z全面完整获取待研究物种样本基因组结构信息的研究策略。它可以获取全部基因组变异体结构,包括点突变SNP/短插入缺失(indel),基因组重排导致的结构变异(SNV),拷贝数变异(CNV), 杂合性缺失(LOH),重复区段(SD),以及重组热点区域(Recombination Hot spots)等基因组特征和规律。基于精确稳定的Hiseq2500高通量测序平台,凭借多年稳定信息学研究分析经验,惠研生物(BioGenius)可利用基因组测序数据进行重排突变和基因组结构功能分析; 全基因组关联分析与数量性状(QTL)分析;并可整合多方面基因组学数据做关联分析,包括转录组学数据,表观组数据等,可配合比较基因组学,群体遗传学分析技术,进化分析和计算生物学分析方法深入探索感兴趣的科学问题。
全基因组适用于:
- 基于家系遗传病研究;
- 复杂疾病研究;
- 基因组进化,
- 种群体遗传学与性状连锁等研究。
更多详情:http://www.biogenius.cn/htm/products/genomics/wgs/analysis/248.html
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